丙二酰辅酶A（malonyl-CoA）是脂肪酸/醇、黄酮类化合物和多酮类等工业价值产物生物合成的主要前体，但其在多数微生物宿主中胞内含量有限，制约了相关化学品生产。为此，作者提出一种多水平优化工作流，利用现代代谢工程技术系统提高 Pseudomonas putida 中 malonyl-CoA 水平。该工作流包括通过基因组尺度模型和...
生物传感器用于工业微生物中检测并量化化学品，但多数依赖工程化转录因子识别特定分子，通用性受限。本研究通过工程化非致病土壤菌 Pseudomonas putida，构建可调节的全细胞化学传感器平台。该平台将荧光报告基因与中心代谢中的合成营养缺陷型整合，使目标分析物在生长偶联体系中补充代谢缺陷并驱动菌体生长，从而以生物量和 msfGFP...
吲哚是植物和某些细菌中天然存在的生物活性化合物，也是医药、化工和农业领域的重要特种化学品，并已被鉴定为哺乳动物肠道细菌的重要信号分子。尽管多种细菌中吲哚生物合成的调控机制已得到研究，但缺乏适用于吲哚产生菌鉴定与监测的体内工具。遗传编码生物传感器可用于代谢物的实时定量分析。本文首次鉴定并表征了来自 Pseudomonas putida...
假单胞菌 Pseudomonas putida KT2440 因可将多种碳源转化为顺,顺-粘康酸等产物而受到关注。此前工程菌株可从葡萄糖生产粘康酸，但周质葡萄糖氧化导致大量 2-酮葡萄糖酸积累，降低产物收率与选择性。删除葡萄糖脱氢酶基因 gcd 可避免 2-酮葡萄糖酸积累，却显著减慢生长和粘康酸生产。本研究采用适应性实验室进化改善不...
本研究以五种微生物构建生化需氧量（BOD）生物传感器，用于评估河流中的低 BOD。作者采用葡萄糖-谷氨酸（GGA）和人工废水（AWW）两种标准液对传感器进行表征与比较。结果显示，在 AWW 校准下，Pseudomonas putida SG10 的响应最好，而 Trichosporon cutaneum IFO10466 的响应极差...
针对土壤和水生生物金属毒性环境标准多基于自由离子活度模型（FIAM）或生物配体模型（BLM），认为生物可利用形态主要是自由金属离子，但多种金属配合物也可被生物利用。本文以土壤细菌 Pseudomonas putida 为对象，测试中性硫酸铜/硫酸镉、负电柠檬酸铜/柠檬酸镉以及正电醋酸铜/氯化镉的生物可利用性。实验保持 Cu 或 Cd...
本研究通过 lacZ 基因融合研究了假单胞菌 Pseudomonas putida X4 中不同 czcRS 操纵子的诱导性与特异性。β-半乳糖苷酶活性结果表明，czcR3 启动子可定量响应锌。作者将无启动子增强型绿色荧光蛋白（egfp）基因与 czcR3 启动子融合并整合到 P. putida X4 染色体中，构建了锌特异性全细胞...
土壤细菌 Pseudomonas putida KT2440 基因组编码大肠杆菌 crp（编码分解代谢抑制蛋白 Crp）和 cyaA（腺苷酸环化酶）基因的单拷贝直系同源物。利用 Dictyostelium 生物传感器在体内检测时，P. putida 细胞产生的 cAMP 水平低于检测限。cyaAP.putida 基因在体内可转录，但...
许多细菌已被工程化以在培养中响应特定分析物产生光学输出，但将其用于土壤中不同化学物种的大范围原位监测仍受限于缺乏可行的铺撒方案。本文报告并验证了一套用于长期保存遗传设计为检测苯、甲苯、乙苯和二甲苯（BTEX）的 Pseudomonas putida 细胞，并将其配方、铺撒和激活到目标地点与时间的综合系统。作者测试了多种冻干保护剂，发...