Logistic Regression of Ligands of Chemotaxis Receptors Offers Clues about Their Recognition by Bacteria.

Frontiers in bioengineering and biotechnology 2017 Sagawa T, Mashiko R, Yokota Y, Naruse Y 等 6 人

由于细菌趋化信号转导相对简单，大肠杆菌 Tar 和 Tsr 双跨膜趋化受体长期被视为生物传感器候选模型。以往研究主要采用 L-天冬氨酸和 L-丝氨酸作为典型配体，但 Tar 和 Tsr 还能识别多种类似物，其识别机制尚不清楚。为提取不同类似物识别的共同特征，作者对 38 个已知吸引物和 15 个非吸引物进行 PM6 量子化学计算，获...

综述或非传感器论文 细菌趋化趋化受体机器学习QSAR

Compounds binding to the S2-S3 pockets of thrombin.

Journal of medicinal chemistry 2009 Nilsson M, Hämäläinen M, Ivarsson M, Gottfries J 等 8 人

本研究设计并合成了一组靶向凝血酶 S2–S3 口袋的小分子化合物，其中部分化合物不与 S1 口袋发生相互作用。作者以脯氨酸作为常见 P2 骨架，结合已知 P3 残基以及不同大小和脂溶性的 P1 取代基，构建定向化合物库。采用表面等离子共振（SPR）生物传感器技术测定化合物与凝血酶的结合常数，结果与传统酶学实验所得 IC50 值良好一...

综述或非传感器论文 凝血酶抑制剂表面等离子共振SPRS2-S3口袋