Journal of molecular biology
2022
Torres-Vázquez B, de Lucas AM, García-Crespo C, García-Martín JA 等 10 人
丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白高度保守且多功能,构成病毒衣壳,是HCV检测与抑制的理想靶标。适配体是通过体外选择获得的单链核酸,在病毒诊断和治疗中应用日益增加。本研究针对6种HCV核心蛋白变体(基因型1全长蛋白两种形式及基因型1–4亲水结构域)分别进行DNA和RNA适配体SELEX选择。通过超深度测序分析适配体群体,鉴定高丰度序列并...
International journal of molecular sciences
2020
Zhang W, Li D, Zhang J, Jiang L 等 6 人
1,1,1-三氯-2-(对氯苯基)-2-(邻氯苯基)乙烷(o,p'-DDT)是一种可通过生物累积对野生动物和人类产生不良影响的内分泌干扰物,其检测日益重要。本研究采用指数富集配体系统进化(SELEX)方案,特别是 Capture-SELEX,从随机单链 DNA 文库中筛选能够特异性结合 o,p'-DDT 的候选适配体。经过 13 轮...
Molecules (Basel, Switzerland)
2018
Liu X, Lu Q, Chen S, Wang F 等 9 人
本文提出一种筛选克伦特罗(CBL)特异性适配体的多技术组合策略。以固定化单链DNA(ssDNA)文库为基础,采用指数富集系统进化(SELEX)筛选适配体,并用实时定量PCR(Q-PCR)监测富集进程;富集文库经高通量测序获得候选序列。随后利用金纳米粒子(AuNPs)比色生物传感器对候选适配体进行初步活性鉴定,并通过圆二色光谱(CD)...
Journal of visualized experiments : JoVE
2015
Martin JA, Smith JE, Warren M, Chávez JL 等 6 人
小分子因作为人体健康与机能状态生物标志物而成为生物传感的重要目标。核酸适配体已越来越多地用作生物传感器识别元件,但面向小分子目标选择适配体需要特殊设计。本文描述了一种用于筛选小分子结构转换适配体的方法及其关键步骤。DNA文库与固定在磁珠上的互补DNA捕获探针杂交,目标分子诱导结合序列发生构象变化,使其从磁珠上解离进入上清,从而与非结...
Talanta
2015
Wang S, Liu J, Yong W, Chen Q 等 8 人
四环素(TC)是常用于预防和控制动物疾病的广谱抗菌药物,食品中TC残留日益受到关注,需要高效分析技术进行食品质量评估。生物传感器因可满足传统方法难以实现的部分需求,成为食品安全分析中的有前景工具。本研究开发了一种新型比色适配体传感器,用于蜂蜜中TC的灵敏检测。该传感器基于改进的直接竞争酶联适配体检测(dc-ELAA)方案,采用经指数...
Chemical communications (Cambridge, England)
2014
Nguyen VT, Kwon YS, Kim JH, Gu MB
本文报道一种简单、快速、高通量的小分子适配体筛选方法——简单多 GO-SELEX。该方法利用氧化石墨烯(GO)作为无固定靶标的筛选平台,先以反靶标去除随机单链 DNA 文库中的非特异性序列,再让 GO 吸附 ssDNA,随后加入 tebuconazole、inabenfide 和 mefenacet 三种农药混合物,使与靶标结合的适...
Biosensors & bioelectronics
2014
Kim CH, Lee LP, Min JR, Lim MW 等 5 人
土霉素(oxytetracycline, OTC)是用于控制动物疾病的常用抗菌药物,其滥用可能危害人类健康。本研究开发了一种基于单链 DNA(ssDNA)适配体的生物传感器,用于检测 OTC。通过系统进化指数富集配体(SELEX)筛选 OTC 结合探针适配体,并用酶联适配体检测(ELAA)鉴定其结合特性。在筛选得到的 5 个适配体中...
Journal of biomolecular screening
2011
Choi JS, Kim SG, Lahousse M, Park HY 等 9 人
炭疽杆菌(Bacillus anthracis)分泌的保护抗原(protective antigen, PA)是重要的毒力因子,也被选作细菌感染检测的生物标志物。本研究采用系统进化指数富集(SELEX)技术,从随机单链 DNA 文库中筛选能紧密结合 PA63 的寡核苷酸适配体。经过 8 轮体外筛选,获得 4 个含 30 个碱基序列的...