微生物群落对环境线索高度敏感，其结构与活性可随条件改变。作者假设宿主相关微生物群落，尤其是定殖于宿主表面的群落，可作为原位传感器，揭示微生物与宿主共同经历的环境条件。为验证该概念，研究采用植物-土壤模型系统，以番茄和生菜为宿主，用低质量水（处理废水，TWW）灌溉诱导宿主胁迫，并采用非确定性基因中心方法。研究对植物根系相关微生物群落的...
生物催化环化对高效合成ε-己内酰胺和δ-戊内酰胺等生物基化学品具有重要意义。为筛选内酰胺生物合成中的环化酶，作者开发了己内酰胺检测型遗传酶筛选系统（CL-GESS）。该系统采用粪产碱杆菌（Alcaligenes faecalis）来源的调控蛋白 NitR，使其能够特异性识别内酰胺化合物，并避免内酰胺生物合成中间体的干扰。作者通过系统...
随着证据积累，N-酰基高丝氨酸内酯（AHL）介导的群体感应（QS）和群体淬灭（QQ）在海洋环境中的重要性日益受到关注，但多数数据来自特定微生境，自由生活海洋细菌中的相关活性仍不清楚。本研究分析了地中海90 m和2000 m深度获得的605株可培养细菌的QS和QQ活性，并在同一采样点15–2000 m不同深度的宏基因组数据中搜索潜在Q...
自然界中绝大多数微生物尚未培养，功能未知。序列宏基因组只能回答“谁在那里”，不能回答“它们在做什么、谁在做以及如何做”。功能宏基因组可揭示基因功能，但受筛选特异性和灵敏度限制，尤其难以鉴定表达无可区分活性或表型的基因。本文报道基于生物传感器的基因转导器（BGT）技术，利用全细胞生物传感器定量检测插入基因编码的指定功能表达，以筛选未培...
为从不可培养环境微生物中发掘新型群体感应（QS）系统，作者以森林土壤和焦化厂活性污泥构建 fosmid 宏基因组文库，并利用基于绿色荧光蛋白（GFP）的大肠杆菌生物传感器菌株 E. coli JB525-MT102（pJBA132）进行筛选。该报告菌在 N-酰基-L-高丝氨酸内酯（AHL）诱导下表达不稳定 GFP，通过荧光检测识别可...
群体感应（QS）是细菌依据细胞密度协调行为的细胞间通讯系统，其中变形菌产生的酰基高丝氨酸内酯（AHL）研究最深入。为了解未培养微生物的 QS 系统及其在自然环境中的信号作用，作者用根癌农杆菌生物传感器菌株 HC103(pJZ381) 筛选由活性污泥和土壤 DNA 构建的宏基因组文库，寻找新型 QS 合成酶基因。共鉴定到三个编码 QS...