4 条结果 关键词:计算建模 ×

Detection of Human Neutrophil Elastase by Fluorescent Peptide Sensors Conjugated to TEMPO-Oxidized Nanofibrillated Cellulose.

International journal of molecular sciences 2022 Mackin RT, Fontenot KR, Edwards JV, Prevost NT 等 8 人

用于光学蛋白酶检测的肽-纤维素共轭物因其在即时检测(POC)中的应用潜力而受到关注。慢性病患者中丝氨酸蛋白酶水平常升高,因此需要优化生物传感器设计以支持 POC 评估。纳米纤维素可作为蛋白酶传感器的换能表面,其生物相容性和高比表面积有助于灵敏检测稀薄生物标志物。然而,要改进蛋白酶传感器设计,仍需理解换能表面与传感器分子在时空上的关系...

Method for Developing Optical Sensors Using a Synthetic Dye-Fluorescent Protein FRET Pair and Computational Modeling and Assessment.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2017 Mitchell JA, Zhang WH, Herde MK, Henneberger C 等 7 人

基于 Förster 共振能量转移(FRET)的生物传感器可用于可视化生物和生理过程,并能在空间与时间维度提供详细信息。在 FRET 型生物传感器中,底物结合会引起两个荧光团相对位置变化,从而改变 FRET 效率,并可在荧光光谱中观察到。因此,其设计需要一种结合配体后发生构象变化的配体结合蛋白。然而,并非所有配体结合蛋白在与荧光蛋白...

Design of fluorescent fusion protein probes.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2010 Pham E, Truong K

许多荧光探针依赖荧光蛋白对之间的荧光共振能量转移(FRET)来报告细胞事件。当融合传感蛋白响应细胞事件发生构象变化时,供体与受体之间的能量转移效率随之改变,因此可通过FRET效率变化关联目标分子或细胞过程。本文介绍基于结构的计算设计策略:利用候选FRET生物传感器各结构域的三维结构,对柔性连接区进行构象采样,并预测距离因子、取向因子...

Chapter 21: Quantitative fluorescence lifetime imaging in cells as a tool to design computational models of ran-regulated reaction networks.

Methods in cell biology 2008 Kalab P, Pralle A

理解细胞功能常需对复杂胞内通路进行定量描述。荧光寿命成像显微镜(FLIM)结合 Förster 共振能量转移(FRET)分子生物传感器的发展,使活细胞内生化活性的精确测量成为可能。本文讨论如何将定量活体成像与体外生化表征相结合,建立用于模拟生化网络行为的计算系统模型,并以有丝分裂纺锤体组装中 Ran GTPase 功能的计算建模为例...