Experimental and 'in silico' analysis of the effect of pH on HIV-1 protease inhibitor affinity: implications for the charge state of the protein ionogenic groups.

Bioorganic & medicinal chemistry 2012 Domínguez JL, Gossas T, Carmen Villaverde M, Helena Danielson U 等 5 人

本研究通过表面等离子共振（SPR）生物传感器分析，在三个pH值下测定一系列HIV-1蛋白酶（HIV-1 PR）抑制剂的相互作用动力学，以考察抑制剂结合亲和力对pH的依赖。作者以不同质子化状态的HIV-1 PR–抑制剂复合物结构为起点，采用基于分子力学的计算协议解释实验结果。SPR实验显示不同抑制剂具有多种结合亲和力的pH依赖模式，而...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 HIV-1蛋白酶抑制剂亲和力pH依赖质子化状态

Effect of the protonation state of the titratable residues on the inhibitor affinity to BACE-1.

Biochemistry 2010 Domínguez JL, Christopeit T, Villaverde MC, Gossas T 等 10 人

BACE-1是参与β-淀粉样肽切割的天冬氨酸蛋白酶，其催化APP水解是阿尔茨海默病淀粉样斑块形成的限速步骤。寻找新型BACE-1抑制剂的关键问题之一是抑制剂与酶结合的最适pH：酶在酸性pH催化活性最高，而细胞活性抑制剂可能在较高pH结合最优。本研究采用基于表面等离子共振（SPR）生物传感器的方法，测定一组化学基团多样的抑制剂对BAC...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 BACE-1抑制剂pH依赖结合质子化状态阿尔茨海默病