STAR protocols
2022
Müller PM, Rocks O
Rho家族GTP酶是细胞骨架动态的核心调控因子,其活性受鸟苷酸交换因子(RhoGEF)和GTP酶激活蛋白(RhoGAP)调控。本方案提供一套稳健、可高通量筛选的活细胞荧光共振能量转移(FRET)生物传感器检测流程,用于在天然细胞环境中分析RHOA、RAC1和CDC42等GTP酶活性变化。该传感器为遗传编码单链报告蛋白,包含循环置换m...
Journal of molecular and cellular cardiology
2022
Rebbeck R, Ginsburg KS, Ko CY, Fasoli A 等 10 人
心力衰竭和心律失常的关键治疗靶点是肌浆网(SR)ryanodine受体2(RyR2)钙释放通道的病理性钙泄漏。作者此前通过监测RyR2与钙调蛋白(CaM)或生物传感器肽DPc10的结合,检测成人心肌细胞中病理性泄漏RyR2。本研究检验这些互补结合测量能否作为高通量筛选(HTS)方法,发现靶向泄漏RyR2的小分子。利用FRET,在模拟...
Journal of molecular and cellular cardiology
2022
Kanassatega RS, Bunch TA, Lepak VC, Wang C 等 5 人
心肌肌球蛋白结合蛋白C(cMyBP-C)是肌节粗丝相关蛋白,也是治疗心衰收缩功能障碍的潜在靶点。通过小分子药物结合模拟磷酸化cMyBP-C的结构动态,可调节其构象状态并改善收缩功能。本研究开发了一种人源cMyBP-C生物传感器,用于检测磷酸化和突变引起的分子内结构变化。作者利用定点突变和时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET),在...
Biosensors
2022
Iruela G, Fernández A, Sagar A, Carvajal FJ 等 6 人
在信号转导蛋白中,内在无序区常作为调控元件,对环境变化、配体结合和翻译后修饰敏感。无序区所采样的构象空间可受环境刺激影响,并通过效应结构域触发下游过程。这类调控元件的无序性使其能够整合信号并产生分级响应,但也阻碍了基于固定三维结构的传统药物筛选方法。作者设计了一种可遗传编码的生物传感器,用于检测 c-Src 激酶 N 端调控元件(S...
Nature communications
2022
支链氨基酸(BCAA)代谢具有多种生理功能,并可被用于生产高价值化学品。然而,目前缺乏特异性针对 BCAA 衍生产物的真核生物传感器,限制了用于菌株工程与代谢研究的高通量筛选的发展。本研究利用酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)转录调控因子 Leu3p 开发了一种遗传编码的 BCAA 代谢生物传感器。在一种构...
The Journal of biological chemistry
2022
Zhang J, Singh DP, Ko CY, Nikolaienko R 等 17 人
ryanodine receptor (RyR) 是肌浆网 Ca2+ 释放通道,其 N 端区域 (NTR) 调控兴奋-收缩耦联中的 Ca2+ 释放,并富含与骨骼肌 RyR1 和心肌 RyR2 肌病相关的突变。本研究在小鼠 RyR2 NTR 的 A、B、C 结构域引入 FRET 供体-受体对,构建 AC-NTR 和 BC-NTR 两种...