The Programmable Catalytic Core of 8-17 DNAzymes.
8-17 DNAzyme（8-17、17E、Mg5 和 17EV1）是体外筛选获得的催化性 DNA 分子，可切割互补 RNA。其相似催化核心中的保守残基与金属离子共同促进催化反应。基于凸环（bulge loop）中保守性较低的残基（W12、A15、A15.0）及内部茎对催化活性的贡献，本研究对 8-17 DNAzyme 的催化核心进...
Structure of a 10-23 Deoxyribozyme Exhibiting a Homodimer Conformation.
脱氧核酶（DNAzyme）是体外筛选获得的具有催化活性的 DNA 序列。RNA 切割型 10-23 DNAzyme 是最早被筛选出的 DNAzyme，可作为生物传感器和基因敲低试剂，具有无需其他组分、可周转催化等优势。然而，由于缺乏结构和机制信息，其优化与应用受限。本文报道了 RNA 切割型 10-23 DNAzyme 在均聚二聚体...
Structure of a 10-23 deoxyribozyme exhibiting a homodimer conformation.
脱氧核酶（DNAzyme）是通过体外进化获得的具有催化化学反应能力的 DNA 序列。RNA 切割型 10-23 DNAzyme 是最早被进化得到的 DNAzyme，可作为生物传感器和基因敲低试剂用于临床与生物技术领域。与 siRNA、CRISPR 和吗啉代寡核苷酸等敲低方法相比，DNAzyme 无需招募其他组分即可切割 RNA，并可...
An Unintentional Discovery of a Fluorogenic DNA Probe for Ribonuclease I.
核糖核酸酶I属于非特异性内切核糖核酸酶，在多种生物和细胞过程中发挥重要作用。其普遍存在和高活性导致实验中RNase污染问题，而细菌中丰富也可作为生物传感器靶标。因此，开发特异可靠的RNase检测探针具有重要意义。作者报道通过体外选择偶然发现的RNase I探针RFA13-1，选择靶标为受肺炎克雷伯菌污染的艰难梭菌粗细胞外混合物。表征...
In vitro selection of RNA-cleaving DNAzymes for bacterial detection.
DNAzyme 是具有催化活性的单链 DNA 分子，可通过体外筛选从合成随机序列 DNA 文库中分离获得。RNA 切割 DNAzyme 是研究最深入的 DNAzyme 类别之一，已广泛用于多种分析物的生物传感器和生物检测。本文聚焦于将 RNA 切割 DNAzyme 开发为细菌传感器，这类探针被设计为同时完成三项关联功能：识别细菌生物...
Detection of bacteria using fluorogenic DNAzymes.
食源性和医院获得性病原体暴发每年造成大量死亡、住院和经济损失，因此需要能在最早阶段准确识别致病菌的分析方法。理想检测应具备高特异性、高灵敏度（可检测单个活菌）、短出结果时间、操作简便和成本低。传统微生物学方法需数天至数周；PCR 和抗体方法较快，但依赖昂贵试剂或复杂设备。作者研究 DNAzyme 作为分子探针用于细菌检测。DNAzy...
Selection of the most potent specific on/off adaptor-hepatitis delta virus ribozymes for use in gene targeting.
丁型肝炎病毒（HDV）核酶能在人细胞环境中有效工作，是开发基因失活系统的理想候选分子。新一代 SOFA-HDV 核酶通过引入特异性开/关适配体（SOFA）模块，显著提高了核酶的特异性和切割活性。与 RNA 干扰和锤头核酶不同，SOFA-HDV 核酶用于反式切割特定 RNA 的设计过程尚未经历系统优化。本研究旨在改进并明确 SOFA-...