International journal of molecular sciences
2023
Buneeva O, Kopylov A, Gnedenko O, Medvedeva M 等 8 人
亲和蛋白质组学广泛用于鉴定参与多种互作组形成的蛋白。蛋白-蛋白相互作用可反映特定蛋白在细胞中的功能,对多功能蛋白尤其重要。丙酮酸激酶(PK)是催化糖酵解最后一步的经典酶,存在PKM1、PKM2、PKL和PKR四种亚型。PKM2在增殖细胞中表达并具有多种非经典“月光”功能,而主要在成人分化组织表达的PKM1缺乏明确记录的月光功能。为评...
ACS sensors
2021
Incaviglia I, Frutiger A, Blickenstorfer Y, Treindl F 等 10 人
近年来,细胞基检测广泛用于分子相互作用分析,可补充传统生化与生物物理方法,在生理相关条件下进行相互作用分析、作用机制研究和药物筛选。多数细胞检测需标记生物分子以获得特异性。为克服标记法缺点,作者此前提出“细胞基 molography(分子衍射术)”作为生物传感器,用于分析活细胞中涉及天然膜受体的特定分子相互作用。本文将该方法扩展到胞...
ACS chemical biology
2018
以时空精度控制Cas9的系统可减少副作用、保护敏感组织,并实现仅在特定时间和地点激活的基因治疗。本文提出基于RNA聚合酶(RNAP)生物传感器的新型Cas9控制器设计,通过产生向导RNA(gRNA)来调控目标基因敲除。作者首先开发并验证了新的脱落酸(ABA)诱导生物传感器用于控制Cas9,随后利用噬菌体辅助连续进化(PACE)降低系...
Journal of molecular cell biology
2016
Mo XL, Luo Y, Ivanov AA, Su R 等 9 人
大型基因组学研究产生了大量数据,但如何快速解析复杂的蛋白-蛋白相互作用(PPIs)以支持功能研究和治疗干预仍是挑战。现有PPI检测技术虽多,但能在哺乳动物活细胞环境中同时具备高灵敏度与稳健性的单一PPI生物传感器平台仍缺乏。本文开发并整合了一种基于NanoLuc荧光素酶的高灵敏生物发光共振能量转移技术,称为BRETn,用于活细胞中超...
Biosensors & bioelectronics
2014
Nirantar SR, Li X, Siau JW, Ghadessy FJ
作者基于此前开发的模块化均相肽基生物传感器,将核酸酶保护检测的基本机制移植到蛋白体系,建立蛋白酶排除(PE)检测。该检测将蛋白-肽识别区、邻近蛋白酶切割位点和信号产生单元整合于同一检测肽或融合蛋白支架中;当靶蛋白结合识别肽时,空间位阻阻止蛋白酶接近切割位点,信号被抑制;当蛋白-蛋白相互作用被小分子或肽类拮抗剂阻断时,蛋白酶可切割检测...
Journal of computer-aided molecular design
2011
Wartchow CA, Podlaski F, Li S, Rowan K 等 7 人
基于生物传感器的小分子片段筛选是药物发现中的有价值工具。与许多生化方法相比,该方法可通过检查结合谱和响应,将主要命中与非特异性或非理想相互作用区分开,从而降低假阳性率。生物层干涉(BLI)通过测量可见光从光学层和含感兴趣蛋白的生物层反射所产生的干涉图案变化来监测小分子相互作用,是一种较新的方法。BLI 采用浸入 96 孔或 384 ...
Journal of the American Chemical Society
2009
Heeres JT, Kim SH, Leslie BJ, Lidstone EA 等 6 人
小分子对蛋白-蛋白相互作用的抑制或增强具有重要价值,但高通量鉴定仍困难。现有方法包括ELISA、荧光偏振和SPR,但难以同时满足高通量与多事件检测。本文开发基于光子晶体(PC)生物传感器的高通量检测策略,仅需His6标签蛋白及其对应伴侣蛋白。PC表面由亚波长聚合物光栅涂覆TiO2构成,可共振反射单一波长,生物材料吸附会改变峰值波长值...