本研究利用光栅耦合干涉（GCI）生物传感器，采用新型多路复用实验设计，对含1056个片段的小分子库进行筛选，以鉴定靶向SMYD3的新配体。SMYD3是抗癌药物潜在靶点，早期研究主要关注其赖氨酸甲基转移酶活性抑制剂，但SMYD3具有多个蛋白互作伙伴并在致癌中可能发挥多种作用，因此靶向该蛋白的配体作用方式尚不明确。作者旨在区分结合活性位...
生物传感器技术在基于片段的药物发现中日益重要。AAA+ ATP酶p97是维持蛋白稳态的关键蛋白，也是癌症化疗潜在靶点。现有p97抑制剂主要抑制其ATP酶活性，会全局干扰p97介导的多种过程；若通过蛋白-蛋白相互作用抑制剂阻断辅因子与N结构域结合，则可选择性调控特定功能。本文建立基于生物层干涉（BLI）的片段筛选方法，以p97 N结构...
蛋白质功能常依赖配体诱导的构象变化，但常规生物物理筛选通常不能直接揭示配体如何影响其功能。本文开发了一种高通量第二谐波产生（SHG）生物传感器，用于实时检测与蛋白结合后诱导构象变化的片段并识别动态区域。作者以乙酰胆碱结合蛋白（AChBP）为模型，建立野生型和六个单半胱氨酸突变体的多孔板SHG检测体系，并通过胺基或马来酰亚胺化学偶联第...
本文建立了以克氏锥虫法尼基焦磷酸合酶（tcFPPS）为靶标、用于表面等离子共振（SPR）生物传感器驱动片段筛选的方法体系。针对初始蛋白稳定性差和缺乏合适参考化合物的问题，作者优化了表达、纯化、储存与处理条件，获得纯度高于90%、折叠完整且呈二聚体的重组tcFPPS，并确定其可长期稳定保存。通过差示扫描荧光、固有荧光、圆二色和动态光散...
利什曼病是由利什曼原虫引起的被忽视热带病，现有治疗药物有限且无疫苗。UDP-葡萄糖（UDP-Glc）和 UDP-半乳糖（UDP-Gal）的生物合成对原虫存活至关重要，受 UDP-葡萄糖焦磷酸化酶（UGP）和 UDP-糖焦磷酸化酶（USP）控制。本研究以 L. major USP 为靶标，采用生物层干涉（BLI）技术筛选 965 个小...
转化生长因子β激活激酶1（TAK1）是MAPKKK家族成员，介导多种促炎细胞因子信号，是抗炎药物潜在靶点。本研究未采用高通量生化筛选，而是利用已有激酶抑制剂知识，对有限化合物库进行基于生物传感器的生物物理筛选，以寻找具有良好选择性的TAK1抑制剂。作者并行搜索三类结合模式：ATP竞争性DFG-in的I型、DFG-out的II型以及非...
片段药物设计（FBDD）过去15年与高通量筛选共同推动药物发现，已产生30多个进入临床的片段衍生化合物和至少1个上市药物。基于表面等离子共振（SPR）的无标记生物传感器技术因灵敏、信息丰富，已可用于片段初筛和验证。本综述概述 SPR 原理与仪器发展，评价其在片段筛选中的优势与适配策略，包括目标蛋白固定化、再生传感器、选择性/假阳性判...
表面等离子共振（SPR）因蛋白用量低且无需标记，已成为低分子量片段库筛选的主要生物物理方法之一。SPR 生物传感器相互作用分析可用于筛选和确认片段与靶标蛋白的结合，并提供结合亲和力、动力学乃至热力学参数。SPR 用于片段筛选的最先进应用是面向膜蛋白药物靶标，尤其是 G 蛋白偶联受体（GPCR）。基于 SPR 的 GPCR 生物物理检...
本文报道一种用于片段筛选的新型板载光学生物传感器方法，可在384孔板中运行。该方法基于溶液抑制实验（ISA），将专门设计的靶标定义化合物（TDC）共价固定于传感器表面；TDC依据磷酸二酯酶10A（PDE10A）的晶体结构信息设计，使其保留与靶标蛋白结合的能力。重组PDE10A催化域与固定TDC结合后，传感器表面质量增加，导致反射光特...
过去二十年，光学生物传感器系统取得显著进步，已成为现代药物筛选中重要且增值的组成部分。微孔板型生物传感器系统的引入有望在不牺牲数据质量的前提下满足高通量需求，是传统流体系统的理想补充。本文重点介绍两种最具代表性的光学生物传感器技术——表面等离子共振（SPR）和光学波导光栅（OWG）在小分子筛选中的应用，并系统阐述、比较和讨论这些平台...
表面等离子共振（SPR）是一种快速、高效、经济且准确的生物物理片段筛选方法。SPR 越来越多地被用作二级检测，以验证由其他方法发现的片段命中物。近年来，技术进步使 SPR 逐渐发展为片段导向药物发现中的一级筛选技术。此外，SPR 生物传感器检测体系可针对多种蛋白建立，包括 G 蛋白偶联受体等膜蛋白。本综述讨论 SPR 片段筛选的优势...
基于生物传感器的小分子片段筛选是药物发现中的有价值工具。与许多生化方法相比，该方法可通过检查结合谱和响应，将主要命中与非特异性或非理想相互作用区分开，从而降低假阳性率。生物层干涉（BLI）通过测量可见光从光学层和含感兴趣蛋白的生物层反射所产生的干涉图案变化来监测小分子相互作用，是一种较新的方法。BLI 采用浸入 96 孔或 384 ...
本研究设计并实验验证了一种用于表面等离子共振（SPR）生物传感器筛选的新片段库。该库从460万种可购买商品化合物中，经一系列理化性质和药物化学过滤，最终选出930个片段化合物。作者将片段库针对3个典型药物靶标——HIV-1蛋白酶、凝血酶和碳酸酐酶——以及1个非靶标蛋白人血清白蛋白进行筛选。在筛选条件下，化合物溶解性良好。高灵敏度传感...
基于片段的药物发现是发现候选药物的有效策略。然而，片段化合物亲和力弱，需要核磁共振（NMR）或X射线晶体学等高灵敏度生物物理技术来鉴定活性片段，因此筛选小片段库的优势部分被生物物理分析的高成本抵消。本文报道了一种基于表面等离子共振（SPR）生物传感器的片段筛选方法。为降低假阳性检出率，作者提出一种将多重参考扣除与配体效率相结合的数据...
可溶性乙酰胆碱结合蛋白（AChBP）是烟碱型乙酰胆碱受体（nAChR）配体结合结构域的同源物。为引导未来采用表面等离子共振（SPR）生物传感器技术进行无标记、直接结合的生物物理片段筛选，作者基于对一组具有纳摩尔亲和力的α7 nAChR选择性含奎宁环配体的解构，构建了聚焦片段库。利用SPR生物传感器检测片段及其母体化合物与AChBP的...
本文报道了一种用于SensíQ Pioneer表面等离子共振（SPR）生物传感器的新型分析物注射方法，称为FastStep。该方法通过在反应流池入口前立即合并缓冲液流和样品流，使仪器能够仅从单个分析物样品自动产生二倍或三倍稀释系列，分别包含七个或五个浓度，从而覆盖约100倍浓度范围。作者利用蔗糖注射证明各浓度阶梯在起始时间和响应水平...
本文评估了富士胶片新型 AP-3000 表面等离子共振（SPR）生物传感器在动力学分析和片段筛选中的性能。作者以碳酸酐酶 II（CAII）为模型体系，表征了 10 种磺酰胺类小分子抑制剂，分子量 98–341 Da，亲和力约跨越 10000 倍（0.4 mM 至 20 nM）。虽然 AP-3000 所得数据总体与 Biacore T...
表面等离子共振（SPR）生物传感器技术已趋于成熟，成为药物发现的重要工具。它是一种无标记生物物理技术，用于分子相互作用的动力学分析，可提供信息量极高的数据。近年来在灵敏度、实验设计、数据分析与样品通量方面的改进，使其适用于药物发现全过程。本文概述 SPR 生物传感器技术在小分子药物发现中的应用，并说明其如何与其他技术互补。该技术对基...