ACS synthetic biology
2023
Park J, Abramowitz RG, Gwon S, Cheung LS
糖最终会被转运的转运体(SWEETs)是保守的糖转运体,在植物生理和生物技术中发挥关键作用。开花植物基因组通常编码约20个SWEET旁系同源基因,可分为四个进化枝;其中I、II和IV进化枝偏好己糖,III进化枝偏好蔗糖。然而,该家族成员识别底物所需的分子特征尚未被详细研究。本文表明,先前报道的由拟南芥Clade I AtSWEET1...
ACS omega
2020
Li ZY, Shi YL, Liang GX, Yang J 等 11 人
葡萄糖转运体1(GLUT1)介导葡萄糖摄取,其实时转运监测对理解 GLUT1 表达和葡萄糖代谢至关重要。本研究建立 mCherry-EGFP-GLUT1 串联荧光追踪系统,用于活细胞中 GLUT1 在质膜(PM)与内溶酶体系统间转运的可视化。质膜定位的 GLUT1 同时发出 mCherry 红色和 EGFP 绿色荧光,重叠呈黄色;葡...
Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
2019
Lo CH, Lim CK, Ding Z, Wickramasinghe SP 等 9 人
理解阿尔茨海默病及相关 tau 病中异质性病理是发现疾病修饰疗法的关键挑战。本文提出一种基于时间分辨荧光共振能量转移(time-resolved FRET, TR-FRET)的细胞内生物传感器技术,用于监测细胞中自发形成的有毒与无毒 tau 寡聚体集合。tau 病以微管结合蛋白 tau 的病理性聚集为特征,近年证据提示可溶性 tau...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2018
Okamoto M, Cutler SR
本章介绍利用小分子化合物调控脱落酸(ABA)受体以增强植物耐旱性的方法。ABA 通过 PYR/PYL 受体结合并抑制蛋白磷酸酶 2C(PP2C),从而激活 SnRK2 激酶和下游 ABA 信号。作者利用表达 ABA 受体与 PP2C 的尿嘧啶营养缺陷型酵母双杂交系统构建 ABA 传感器,高通量筛选能促进受体–PP2C 互作的小分子激...
Expert opinion on drug discovery
2017
Kaminski T, Geschwindner S
本文综述光学生物传感器在小分子药物筛选中的应用与展望。作者指出,表面等离子共振(SPR)、光学波导光栅(OWG)和生物层干涉(BLI)等无标记光学平台已成为药物发现中重要的生物物理工具,可实时监测化合物与靶蛋白或完整细胞的相互作用,提供结合动力学、热力学及细胞功能响应信息。文章提出成功应用取决于“正确通量、正确灵敏度、正确试剂”,并...
Enzyme and microbial technology
2016
Surwase SV, Patil SA, Srinivas S, Jadhav JP
漆酶在工业与生物技术中具有广阔应用前景,其对酚类化合物的亲和力使其在生物修复领域尤为重要。本研究将表面等离子共振(SPR)作为生物传感器,把漆酶固定化于芯片表面,用于研究小分子与漆酶的相互作用。漆酶采用硫醇偶联法固定,随后在毫摩尔浓度范围内分析含有不同数量羟基化合物的结合亲和力。研究考察了间苯三酚、藏红花素、抗坏血酸、曲酸和藏红花等...
Critical reviews in analytical chemistry
2015
Olaru A, Bala C, Jaffrezic-Renault N, Aboul-Enein HY
本综述系统总结了表面等离子共振(SPR)这一重要光学生物传感技术在药物发现过程和药物化合物质量分析中的应用及其特点。文章介绍了 SPR 的常见检测格式与实验问题,并说明其如何用于药代动力学药物分析、ADMET 研究、高通量筛选以及基于片段的药物筛选,其中后者重点讨论小分子药物检测。综述还阐述了经典 SPR 方法的优势,以及局域表面等...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2013
Frostell A, Vinterbäck L, Sjöbom H
表面等离子共振(SPR)生物传感器技术已成为药物发现和基础研究的重要工具。SPR 仪器可用于测定相互作用的结合动力学与亲和力、特异性研究、筛选、方法开发以及浓度测定。相互作用分子可以是蛋白、肽、脂质、病毒、核酸,也可以是片段或候选药物等小分子有机物。由于能够实时获得信息,SPR 使抗体和小分子/片段相互作用分析从依赖标记及亲和力/I...
Sensors (Basel, Switzerland)
2012
Geschwindner S, Carlsson JF, Knecht W
过去二十年,光学生物传感器系统取得显著进步,已成为现代药物筛选中重要且增值的组成部分。微孔板型生物传感器系统的引入有望在不牺牲数据质量的前提下满足高通量需求,是传统流体系统的理想补充。本文重点介绍两种最具代表性的光学生物传感器技术——表面等离子共振(SPR)和光学波导光栅(OWG)在小分子筛选中的应用,并系统阐述、比较和讨论这些平台...
Journal of computer-aided molecular design
2011
Wartchow CA, Podlaski F, Li S, Rowan K 等 7 人
基于生物传感器的小分子片段筛选是药物发现中的有价值工具。与许多生化方法相比,该方法可通过检查结合谱和响应,将主要命中与非特异性或非理想相互作用区分开,从而降低假阳性率。生物层干涉(BLI)通过测量可见光从光学层和含感兴趣蛋白的生物层反射所产生的干涉图案变化来监测小分子相互作用,是一种较新的方法。BLI 采用浸入 96 孔或 384 ...
Assay and drug development technologies
2011
Vela L, Lowe PN, Gerstenmaier J, Laing LG 等 7 人
光学微孔板生物传感器将无标记检测与工业标准实验基础设施及可扩展性相结合。基于微孔板的无标记平台既可用于量化大分子相互作用,也可用于筛选和表征药物样小分子相互作用。本文以孤儿雌激素相关核受体γ(ERRγ)配体结合域(LBD)为模型,展示该类生物传感器上多种生化检测格式的快速开发与实用性。分别将 ERRγ LBD 或其对应共抑制因子 R...
Annual review of biochemistry
2010
Dietrich JA, McKee AE, Keasling JD
代谢工程用于高价值小分子过量生产,依赖定向进化提高产量。多数目标小分子无色且难以直接筛选。本文综述高通量比色、荧光和生长偶联筛选技术的发展,实现无色小分子检测。首先概述标准定向进化流程中文库构建、转化和筛选的通量限制,并基于小分子检测通量和灵敏度建立筛选与选择阶梯。随后深入分析已证明的小分子检测筛选与选择方法,重点介绍体内生物传感器...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2010
Chen B
朊病毒病又称传染性海绵状脑病(TSEs),是一类累及动物和人类的神经退行性疾病,包括绵羊痒病、牛海绵状脑病、鹿慢性消耗病、人类克雅病及变异型克雅病等。疾病进展与细胞朊蛋白(PrPC)转变为蛋白酶抗性、不溶性错误折叠朊蛋白(PrPSc)并形成淀粉样沉积密切相关,因此 PrPC 和 PrPSc 均被视为潜在药物靶点。由于 PrPSc 不...
Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
2008
Barth AS, Kizana E, Smith RR, Terrovitis J 等 12 人
心脏球来源的驻留心脏干细胞(CDCs)可轻易从成人心脏中分离,并在心衰动物模型中带来功能获益。为研究 CDCs 的心脏向分化,作者建立了一种遗传标记并选择性富集获得心脏表型细胞的方法。结果显示,慢病毒载体在 CDCs 中的转导效率显著高于所测 9 种腺相关病毒(AAV)血清型。为确定最适合报告心脏向分化的载体系统,作者比较了 5 种...