Bio-protocol
2023
Puopolo T, Li H, Gutkowski J, Cai A 等 7 人
程序性死亡受体1(PD-1)/程序性死亡受体配体1(PD-L1)轴阻断是癌症免疫治疗的重要策略。抗体类PD-1/PD-L1抑制剂虽临床有效,但存在肿瘤渗透性、口服生物利用度、副作用、给药便利性、半衰期和成本等局限,因此开发小分子抑制剂具有重要意义。然而,直接靶向PD-1/PD-L1相互作用的小分子抑制剂仍处早期,部分原因是缺乏可靠的...
The Journal of biological chemistry
2022
Zhang J, Singh DP, Ko CY, Nikolaienko R 等 17 人
ryanodine receptor (RyR) 是肌浆网 Ca2+ 释放通道,其 N 端区域 (NTR) 调控兴奋-收缩耦联中的 Ca2+ 释放,并富含与骨骼肌 RyR1 和心肌 RyR2 肌病相关的突变。本研究在小鼠 RyR2 NTR 的 A、B、C 结构域引入 FRET 供体-受体对,构建 AC-NTR 和 BC-NTR 两种...
Scientific reports
2021
Quinn JG
体外动力学测量可用于表征结合相互作用的机制,在药物发现中从早期靶点确认到临床前优化均具有重要价值。早期化合物常呈现瞬态动力学,难以在常规药物发现中测量;例如不可逆抑制剂传统上依赖烷基化速率常数,但该指标无法解析驱动可逆结合与亲和力复合物失活的基本速率常数,接近扩散极限的极快结合过程也难以测量。为此,本文提出一种实用的动力学再结合检测...
Nanoscale
2017
Andersen MB, Tesauro C, Gonzalez M, Kristoffersen EL 等 12 人
开发新型小分子抗癌药物迫切需要易于获取的传感系统,以测量大量新药物与其潜在细胞靶标之间的相互作用。本文展示了一种光学DNA生物传感器在阐明新型小分子人拓扑异构酶I(hTopI)抑制剂——indeno-1,5-naphthyridines家族成员抑制机制中的应用。通过在生物传感器上分析人拓扑异构酶I的催化过程,并在加入或不加入药物的情...
Analytical biochemistry
2016
Siderius M, Shanmugham A, England P, van der Meer T 等 8 人
过去十年,表面等离子共振(SPR)生物传感器技术被越来越多地用于表征药物靶标与小分子调节剂之间的相互作用。本文报道了SPR方法在分析小分子与两种治疗相关cAMP磷酸二酯酶(PDE)结合中的应用:布氏锥虫PDEB1(与非洲昏睡病相关)和人类PDE4D(与哮喘、慢性阻塞性肺疾病及中枢神经系统疾病等相关)。作者建立了利用His标签PDE催...
Pharmacological research
2016
Sheffield KS, Vohra R, Scott JA, Ross GM
神经生长因子(NGF)是神经营养因子家族成员,通过与 p75NTR 和 TrkA 受体结合影响中枢及周围神经系统中神经元的存活与分化。其前体 proNGF 已被证明是中枢神经系统中 NGF 的主要形式,提示其除作为前体外还具有独立生物学功能。与 NGF 类似,proNGF 也能结合 p75NTR 受体。NGF 和 proNGF 的失...
Journal of biomolecular screening
2016
Wu Y, Stauffer SR, Stanfield RL, Tapia PH 等 18 人
荧光激活蛋白(FAP)是一类新型生物传感器,可特异性结合小分子荧光原,并在结合后使其量子产率从接近0升至约0.5,从而实现高灵敏度荧光检测。与绿色荧光蛋白不同,FAP在未结合荧光原时不发光,因此适合活细胞中受体转运的实时监测。作者将FAP检测平台与高通量流式细胞术结合,对约34万种化合物进行筛选,发现一类能干扰荧光原与FAP结合、从...
Analytical biochemistry
2016
Sheffield KS, Kennedy AE, Scott JA, Ross GM
神经生长因子(NGF)通过结合 p75NTR 和 TrkA 受体调控神经元增殖、分化与存活;NGF 失调与神经退行性疾病及炎症性/神经病理性疼痛相关,因此阻断 NGF-受体相互作用的小分子抑制剂具有治疗潜力。已知小分子拮抗剂 ALE-0540、PD90780、Ro 08-2750 和 PQC 083 均被报道可抑制 NGF 与 Tr...
Journal of biomolecular screening
2016
Kennedy AE, Sheffield KS, Eibl JK, Murphy MB 等 7 人
小分子抑制剂曾被用于慢性疼痛治疗药物的筛选。本研究采用表面等离子共振(SPR)光谱法,对先前通过125I-NGF结合实验鉴定的已知神经生长因子(NGF)抑制剂进行亲和力与结合能力表征。作者建立了一种新的NGF抑制剂表征策略,将NGF固定化于SPR芯片表面,直接测定各化合物与NGF的结合常数(KD)及饱和能力。在筛选的化合物中,74%...
Methods in enzymology
2014
Simard JR, Rauh D
尽管数百种激酶抑制剂处于药物发现和临床前阶段,FDA 批准的激酶抑制剂数量仍明显偏低,反映出激酶抑制剂开发面临的挑战。以 ATP 竞争性抑制剂靶向蛋白激酶是经典策略,但 ATP 结合位点高度保守,常导致抑制剂选择性差。为解决该问题,作者开发了一种高通量筛选技术,可鉴别通过结合激酶结构域变构口袋而稳定非活性激酶构象的抑制剂。本文描述如...
Cancer research
2013
Zhou B, Su L, Hu S, Hu W 等 12 人
核糖核苷酸还原酶(RNR)因在癌细胞 DNA 合成、增殖、转移和耐药中的核心作用而成为抗肿瘤靶点。现有临床 RNR 抑制剂存在半衰期短、易耐药和铁螯合等不足。本研究报道一类新型高效 RNR 抑制剂。通过计算机建模提出 RNR 小亚基 RRM2 C 端尾部附近存在新配体结合口袋,并经定点突变和核磁共振(NMR)验证。通过虚拟筛选美国国...
PloS one
2011
Knauer SK, Fetz V, Rabenstein J, Friedl S 等 15 人
背景:苏氨酸天冬氨酸蛋白酶1(Taspase1)可切割混合性白血病(MLL)蛋白及致白血病MLL融合蛋白,但缺乏小分子抑制剂和细胞功能检测体系。方法/结果:本研究建立了用于在活细胞内探测Taspase1功能的高效细胞生物传感器。该传感器由谷胱甘肽S-转移酶(GST)、自荧光蛋白变体、Taspase1切割位点以及核输入/输出信号组合构...
Analytical biochemistry
2010
Rich RL, Myszka DG
本文评估了富士胶片新型 AP-3000 表面等离子共振(SPR)生物传感器在动力学分析和片段筛选中的性能。作者以碳酸酐酶 II(CAII)为模型体系,表征了 10 种磺酰胺类小分子抑制剂,分子量 98–341 Da,亲和力约跨越 10000 倍(0.4 mM 至 20 nM)。虽然 AP-3000 所得数据总体与 Biacore T...
Analytical chemistry
2008
Kerman K, Song H, Duncan JS, Litchfield DW 等 5 人
本文报道一种用于电化学测定蛋白激酶活性的多用途肽基生物传感器。该传感器以氧化还原活性辅底物腺苷5′-[γ-二茂铁]三磷酸(Fc-ATP)为核心,使激酶催化将γ-磷酸-二茂铁转移到羟基氨基酸上,从而通过电化学检测磷酸化事件。作者将该方法用于监测丝氨酸/苏氨酸激酶CK2以及酪氨酸激酶Abl1-T315I和HER2在缓冲液和细胞裂解液中的...