FEBS open bio
2018
Hantani Y, Iio K, Hantani R, Umetani K 等 9 人
许多已上市蛋白激酶抑制剂通过稳定激酶靶点的非活性构象发挥高选择性,因此亟需通用方法识别稳定非活性构象的抑制剂。本研究建立了一种高通量二次谐波产生(SHG)构象检测法,用于筛选稳定白细胞介素-2诱导T细胞激酶(ITK)非活性构象的小分子。作者构建ITK激酶结构域单点半胱氨酸突变体,用SHG活性染料SHG2-maleimide标记,并通...
Sensors (Basel, Switzerland)
2018
启动子是DNA序列中响应转录因子并启动特定基因表达的小区域。启动子工程生物传感器可通过转录因子识别多胺、糖、内酰胺、氨基酸、有机酸或氧化还原分子,从而激活或抑制基因表达;但相关应用报道较少。本综述介绍了利用人和细菌遗传启动子阵列构建启动子-基因工程生物传感器的策略,并讨论其在高通量筛选(HTS)分子药物、膜蛋白定位与核质穿梭机制研究...
Metabolic engineering
2018
近年来,重组细胞中 D-葡萄糖酸(GA)生产取得进展,亟需高通量筛选和选择性能更优的重组细胞或生物催化剂。2016 年已开发一种在大肠杆菌中将 GA 浓度转化为荧光信号的生物传感器系统,但其应用报道较少。本文建立了一种不依赖微流控平台等专用装置的有效高通量筛选方法,并进行初步应用。在该一锅双菌株体系中,含有 GA 合成途径的产酸菌或...
Scientific reports
2018
Ryoo SR, Yim Y, Kim YK, Park IS 等 13 人
微小RNA(miRNA)是调控基因表达的重要非编码RNA,疾病相关miRNA表达调控对基础研究和治疗均具有重要意义。本文提出一种高通量筛选策略,用于在活细胞中鉴定调控miRNA表达的小分子。该策略基于由肽核酸(PNA)和纳米氧化石墨烯(NGO)组成的新型生物传感器,通过定量荧光信号实时监测活细胞内目标miRNA水平,并同时观察与mi...
Journal of industrial microbiology & biotechnology
2018
Li Y, Qian S, Dunn R, Cirino PC
三乙酰酸内酯(TAL,4-羟基-6-甲基-2-吡喃酮)可转化为多种高价值产品,具有通过代谢工程开发为可再生平台化学品的潜力。作者此前基于大肠杆菌 AraC 调控蛋白构建了内源 TAL 传感器,并用于筛选 2-吡喃合成酶(2-PS)变体文库,在大肠杆菌中鉴定出使液体培养 TAL 产量提高最多 20 倍的变体。本研究进一步优化该传感器-...
Assay and drug development technologies
2018
Nieto A, Fernández-Vega V, Spicer TP, Sturchler E 等 12 人
针对2型糖尿病和肥胖,GPR119因主要表达于胰腺和胃肠道并可能参与葡萄糖稳态而成为药物发现靶点。已有多个先导化合物系列,但药效终点不清,部分系列出现疗效下降和明显毒性。为此,本研究开发并优化了一种高通量筛选策略,用于鉴定人源GPR119的新型强效正向调节剂。该策略采用活细胞检测格式,利用环核苷酸门控通道(CNG)作为细胞内cAMP...
Photochemistry and photobiology
2018
Tienaho J, Poikulainen E, Sarjala T, Muilu-Mäkelä R 等 6 人
紫外线辐射(UV-R)可造成皮肤基因毒性和光老化,防晒霜常用于减轻损伤,但其中合成屏蔽剂可能带来环境危害。天然来源物质有望替代有害防晒化学品,但大量样品筛选繁琐,且常需单独进行基因毒性评估。本文报道一种基于重组大肠杆菌 DPD2794 生物传感器的微孔板技术,用于筛选紫外线防护物质。该菌携带 recA'::lux 报告系统,可在 D...
The Journal of biological chemistry
2018
Guhathakurta P, Prochniewicz E, Grant BD, Peterson KC 等 5 人
我们建立了一种新型时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)检测方法,用于筛选能调节肌动蛋白-肌球蛋白结构与功能的小分子。肌动蛋白-肌球蛋白相互作用对细胞产生力和运动至关重要,其突变或翻译后修饰可破坏肌肉功能并导致危及生命的综合征。本研究将荧光供体连接在肌动蛋白 C374 位点,将非荧光受体连接在包含骨骼肌肌球蛋白必需轻链长亚型 N...
ACS infectious diseases
2018
Voyton CM, Morris MT, Ackroyd PC, Morris JC 等 5 人
布氏锥虫引起人类非洲锥虫病,在哺乳动物宿主体内依赖葡萄糖代谢产生ATP。靶向葡萄糖摄取或调控是潜在治疗策略,但现有方法难以鉴定葡萄糖摄取与调控抑制剂。本文建立了一种基于FRET流式细胞术的高通量筛选方法,用于鉴定降低锥虫细胞质和糖体葡萄糖水平的小分子干扰物。作者将基因编码的荧光蛋白葡萄糖传感器FlII12PGlu-600µ分别表达于...
Applied microbiology and biotechnology
2018
Zhang X, Zhang X, Xu G, Zhang X 等 6 人
L-丝氨酸广泛用于医药、食品和化妆品工业。虽然谷氨酸棒杆菌可从糖直接发酵生产 L-丝氨酸,但产量仍较低。本研究以工程菌 C. glutamicum ΔSSAAI 为出发菌株,采用大气压室温等离子体(ARTP)诱变提高 L-丝氨酸产量,并基于特异性响应 L-丝氨酸的转录因子 NCgl0581 构建新型荧光生物传感器,通过荧光激活细胞分...
The Journal of general and applied microbiology
2018
Mao J, Liu Q, Li Y, Yang J 等 8 人
本研究建立了一种基于甜菜碱素(betaxanthin)合成的全细胞生物传感器筛选方法,用于高通量筛选酿酒酵母 L-酪氨酸(L-tyrosine)高产突变株。将编码酪氨酸羟化酶(TH)和 DOPA 双加氧酶(DDC)的基因导入酿酒酵母 BY4741,构建传感器菌株 NK-WT1。当培养基中存在 L-酪氨酸时,TH 和 DDC 催化其转...
ACS synthetic biology
2018
Hanko EKR, Minton NP, Malys N
衣康酸是重要平台化学品,可替代石化丙烯酸或甲基丙烯酸。土曲霉、大肠杆菌和酿酒酵母等多种微生物已被用于生物合成衣康酸盐,但缺乏高通量筛选方法限制了高滴度菌株和条件的发现。本研究从假结核耶尔森氏菌和铜绿假单胞菌中鉴定出衣康酸诱导启动子及其相应LysR型转录调控因子。结果表明,YpItcR/Pccl诱导系统在模式γ-变形杆菌大肠杆菌和β-...
Scientific reports
2018
Schmitt S, Walser M, Rehmann M, Oesterle S 等 6 人
全细胞催化剂能够催化多步反应,生成工业生物技术或制药领域所需的合成困难化合物,是合成化学的重要工具。然而,细胞催化网络复杂且模型预测能力有限,常需以高通量方式筛选大量半理性构建的变体以发现更优催化剂。本文提出一种空间和时间高效处理超大规模(10^7)重组细胞催化剂库的方法,可在一次高度并行操作中于1分钟内完成整个库的表型表征和阳性变...
SLAS technology
2018
Mella RM, Kortazar D, Roura-Ferrer M, Salado C 等 7 人
本文报道了用于多重高通量细胞G蛋白偶联受体(GPCR)检测的Nomad技术。该技术包含一组名为Nomad Biosensors的荧光生物传感器,可通过G蛋白与第二信使转导蛋白的相互作用,测量GPCR激活后的细胞响应。GPCR是欧几里得生物中最大的膜受体家族之一,其信号转导参与多种生理过程,并与多种疾病相关,是药物研发的重要靶点。No...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2018
Rampioni G, Giallonardi G, D'Angelo F, Leoni L
群体感应(QS)是抑制铜绿假单胞菌宿主适应性和致病性的有前景靶点。过去十年,许多研究聚焦于筛选具有抗QS活性的小分子或蛋白,主要靶向以N-3-氧代十二酰基高丝氨酸内酯(3OC12-HSL)为信号分子的las QS系统。已有多种实验方法用于鉴定干扰3OC12-HSL受体LasR活性/稳定性、合成酶LasI功能,或信号分子本身稳定性/生...
ACS synthetic biology
2018
Liu C, Zhang B, Liu YM, Yang KQ 等 5 人
利用体内生物传感器定量监测胞内代谢物,是筛选高产菌株并实时观察产物积累的有效手段。本研究基于谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)的 LysR 型转录调控因子 ShiR 构建了一种莽草酸(shikimic acid, SA)生物传感器。该传感器在单细胞水平上对胞内 SA 浓度升高具有特异性响应,线性范围...
Biomaterials
2018
Seo J, Shin JY, Leijten J, Jeon O 等 10 人
新型生物材料及其表面修饰技术的快速发展,使传统表征方法难以满足高通量、多参数分析需求。为此,研究者发展了多种高通量(HT)策略,以组合方式系统分析生物材料及其与细胞的相互作用,并揭示递送的溶解性生物活性分子对细胞反应的影响。本综述介绍了近期高通量方法在构建可重复控制细胞行为微环境方面的进展,重点讨论用于基因递送、药物发现和毒理学研究...
Synthetic biology (Oxford, England)
2017
Williams TC, Xu X, Ostrowski M, Pretorius IS 等 5 人
生物传感器是合成生物学中调控基因表达的重要工具。配体响应型转录因子可将胞内代谢物浓度与基因表达偶联,用于动态调控和高通量代谢物生产株筛选。本研究建立酿酒酵母WAR1转录调控因子与PDR12启动子构成的有机酸生物传感器,用于检测莽草酸途径产生的对羟基苯甲酸(PHBA),并以绿色荧光蛋白(GFP)表达作为输出。通过将WAR1转录调控因子...
PloS one
2017
Hsieh MS, Chen MY, Hsieh CH, Pan CH 等 6 人
传统空斑试验和免疫焦点试验用于滴定感染性登革病毒(DENV)颗粒时耗时长且劳动密集。本研究开发了一种基于登革病毒 NS3 蛋白酶活性的 DENV 蛋白酶活性检测系统(DENPADS),用于在细胞中可视化 DENV 感染。作者构建了稳定表达传感模块的 BHK-21 细胞系,该模块由 DENV-2 NS4B 与 NS5 前 10 个 N...
Microbial cell factories
2017
Li H, Chen W, Jin R, Jin JM 等 5 人
丙二酰辅酶A(malonyl-CoA)是脂肪酸、多酮体、芪类和黄酮类等天然产物生物合成的重要前体,但大肠杆菌胞内 malonyl-CoA 水平较低,限制了其合成应用。为快速鉴定能够增强 malonyl-CoA 合成的菌株,作者开发了一种全细胞生物传感器。该传感器基于可响应三乙酸内酯(TAL)的突变 AraC 转录调控蛋白 AraC-...