Current protocols in cell biology
2014
Slattery SD, Hahn KM
生物传感器可用于在体内监测多种蛋白行为,但新传感器的开发与表征往往耗时费力。在传感器设计过程中,需要评估不同结构对特异性、亮度和荧光响应的影响。本文描述一种在 96 孔板格式下使用自动化显微镜进行生物传感器验证的高通量方法。该方法将生物传感器与能够刺激或抑制其报告活性的上游蛋白共表达,从而确定传感器最大激活态与失活态之间的差异,并考...
Methods in enzymology
2014
Simard JR, Rauh D
尽管数百种激酶抑制剂处于药物发现和临床前阶段,FDA 批准的激酶抑制剂数量仍明显偏低,反映出激酶抑制剂开发面临的挑战。以 ATP 竞争性抑制剂靶向蛋白激酶是经典策略,但 ATP 结合位点高度保守,常导致抑制剂选择性差。为解决该问题,作者开发了一种高通量筛选技术,可鉴别通过结合激酶结构域变构口袋而稳定非活性激酶构象的抑制剂。本文描述如...
The Journal of biological chemistry
2014
Song L, 宋 丽, Bachert C, Schjoldager KT 等 6 人
人类最多表达20种多肽GalNAc转移酶(T1–T20),它们定位于高尔基体并启动黏蛋白型O-糖基化。该酶家族调控大量分泌途径蛋白,特定亚型失调与癌症、家族性肿瘤性钙质沉着症、血脂异常等疾病相关,但目前缺乏监测其活性的分子探针,也没有有效的广谱或亚型特异性抑制剂。本文报道了用于T2和T3亚型的蛋白基荧光传感器,二者均在分泌途径中转运...
Mitochondrion
2014
Sahdeo S, Tomilov A, Komachi K, Iwahashi C 等 8 人
重新利用具有线粒体功能效应的美国食品药品监督管理局(FDA)批准药物,可能缩短线粒体疾病药物开发的关键路径。本研究改进了基于生物传感器的线粒体氧消耗检测方法,并在Leber遗传性视神经病变(LHON)和脆性X相关震颤/共济失调(FXTAS)细胞模型中识别出线粒体功能缺陷。作者利用该平台对1600个临床使用药物组成的化合物库进行筛选。...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2014
Michener JK, Smolke CD
定向进化是提升低活性酶催化能力的重要策略,尤其适用于酶被改造以接受新底物或适应新环境的情形。由于酶活性强烈依赖其微环境,筛选条件应尽量接近最终应用场景。当目标酶需要在活细胞内发挥作用时,RNA 生物传感器可将难以直接测量的代谢表型,即目标小分子的生成,与易于检测的荧光表型相连接,从而在活细胞内实现高通量筛选。本文介绍了一种基于合成 ...
Journal of biomolecular screening
2014
Gruber SJ, Cornea RL, Li J, Peterson KC 等 10 人
本研究利用双色肌浆/内质网钙泵(SERCA)生物传感器和新型高通量荧光寿命读板仪(FLT-PR),建立了一种用于筛选扰动 SERCA 结构的小分子的高精度活细胞检测体系。该体系将红色荧光蛋白(RFP)融合于 SERCA N 端,将绿色荧光蛋白(GFP)融合于 N 域内部环,并在可单层或悬浮生长的 HEK 细胞系中稳定表达。通过 FL...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2014
Robinson KH, Yang JR, Zhang J
利用遗传编码荧光或生物发光生物传感器在活细胞中进行化合物筛选,是鉴定特定信号事件新型调控分子的有效策略。活细胞筛选可保持完整信号网络,因此不仅针对单一目标分子,还可发现信号网络中任何能够调节该事件的分子;同时只有细胞可渗透或作用于细胞表面受体的化合物会被识别为命中,从而减少后续细胞渗透性优化。本文提供在96孔板中使用遗传编码生物传感...