随着已知基因组序列数量与多样性增加，利用可穿膜小分子调控基因表达的机会不断增多。增强小沟结合剂对 DNA 序列的识别能力，有望拓展其在转录因子调控等领域的应用。现有小沟结合剂可识别纯 AT 或 AT/GC 混合序列，但难以区分不同 AT 序列。本文报道了一类可选择性结合含 -TTAA- 或 -TATA- 小沟序列、而非其他 AT 序...
本文综述了一类具有良好溶液性质和细胞摄取能力、可选择性识别DNA中混合A·T与G·C碱基对序列的新型杂环双胍化合物的制备。作者旨在说明这些化合物可作为重要的生物技术试剂，并有望成为比现有药物具有更好性质和发展潜力的治疗候选物。综述介绍了通过修饰AT选择性杂环阳离子来识别混合DNA序列的不同策略：为选择性识别G·C碱基对，必须在AT识...
小沟结合发夹多酰胺（PA）可特异性识别DNA序列。合成修饰可提高PA-DNA结合亲和力，包括用β-丙氨酸（β）基团替代吡咯（Py）以引入柔性模块，以及在N端引入阳离子取代基以增加化合物电荷。为理解这些修饰对PA-DNA相互作用动力学和亲和力的影响，作者系统设计和合成了具有不同数量、不同位置β插入以及不同N端阳离子基团的一组PA，使其...
小分子有机化合物对 DNA 的序列特异性识别为外部调控基因表达提供了潜在有效途径，也是细胞生物化学的重要目标。基于已知模块的理性设计可能获得与特定 DNA 序列强而选择性结合的化合物。一种初步策略是从常见的 A·T 碱基对识别分子出发，引入 G·C 识别单元。本文报道了一种合成化合物与 DNA 的相互作用，该化合物利用氮杂苯并咪唑基...
发夹多聚酰胺（hairpin polyamides, PAs）是一类重要的序列特异性 DNA 小沟结合剂，常引入 β-丙氨酸（β）以降低分子刚性并维持 DNA 识别注册。为系统理解 β 对 DNA–PA 结合亲和力、选择性尤其是动力学的影响，作者以八杂环发夹 PA KA1033 及其 β 衍生物为对象，将其内部吡咯系统性地替换为单个...
DB1255是一种对称双胍（diamidine）苯基二噻吩化合物，可通过结合DNA并抑制ERG（ETS家族转录因子）与DNA的结合而表现出细胞活性；ERG常在白血病和前列腺癌中过表达或易位。由于转录因子抑制机制复杂但具有抗癌和抗寄生虫药物开发价值，作者评估了DB1255其他衍生物与DNA的相互作用，以深入理解其复杂功能与抑制的生物物...
杂环二胍类化合物是强效DNA小沟结合剂，并具有良好抗寄生虫活性。为拓展此类化合物的生物活性，作者合成了一系列芳基咪酰胺（arylimidamides, AIAs）类似物；与二胍类相比，AIAs在利什曼原虫和克氏锥虫中的摄取更好。研究采用热变性（Tm）、荧光置换滴定、圆二色（CD）、DNase I足迹、生物传感器表面等离子共振（SPR...
正交定位的双氨基/双阳离子多胺（PAs）相比单氨基/单阳离子类似物具有更好水溶性、更强结合亲和力，并保持DNA小沟结合与序列特异性。本文报道了f-IPI(3a)、f-IPP(4)、f-PIP(5)和f-PPP(6)的合成及DNA结合特性，其中P表示在杂环N1位连接1-丙基氨基的位置。采用DNase I足迹、热变性、圆二色滴定、生物传...
短 AT 碱基对序列被少量 GC 碱基对分隔，常见于真核寄生虫基因组。能够进入细胞并有效、选择性结合此类序列的化合物，为开发抗寄生虫药物提供了有吸引力的策略。作者设计、合成并评估了含一个或两个 amidine-benzimidazole-phenyl（ABP）基团的对称化合物，利用生物传感器-表面等离子共振（SPR）研究其与相邻 A...
传统 DNA 小沟结合剂模型要求分子呈新月形以匹配小沟螺旋曲率，但近年发现一些相对线性且二面角扭转较大的化合物也能强结合小沟，这促使研究者考察曲率要求可放宽的程度。作为实验分析的第一步，作者合成了线性三苯基双胍 DB1111 及一系列含氮三环类似物，旨在将 GC 结合选择性引入可进入细胞并发挥生物效应的杂环化合物。这些化合物从胍基碳...