Nanoscale
2017
Sekhon SS, Lee SH, Lee KA, Min J 等 8 人
本研究基于适配体二级结构及其与铜的结合亲和力,预测了适配体中潜在的铜结合位点。在通过 SELEX 筛选并检测的 4 个适配体(Cu-A1 至 Cu-A4)中,Cu-A2 对铜的结合亲和力最高,其 KD 值最低,为 1.83×10−11 M。为验证铜是否结合于预测区域,作者采用突变和缺失分析对结合亲和力进行实验验证,结果表明高 G–C...
Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
2017
Toulmé JJ, Giangrande PH, Mayer G, Suess B 等 9 人
本报告总结了2016年6月24日至25日在波尔多举行的‘Aptamers in Bordeaux’研讨会。会议围绕适配体的体外选择、结构表征及其在分析、诊断和治疗中的应用展开,涵盖天然与人工核糖开关、RNA调控机制、突变聚合酶和化学修饰核苷酸碱基赋予适配体新功能的最新进展。报告还介绍了适配体平台在多种重大疾病生物标志物多路复用分析中...
Vestnik Rossiiskoi akademii meditsinskikh nauk
2016
Zeninskaya NA, Kolesnikov AV, Ryabko AK, Shemyakin IG 等 6 人
适配体是通过体外定向化学进化(SELEX,系统进化指数富集配体)筛选得到的短单链寡核苷酸,可特异性结合目标分子。SELEX 能够针对多种高、低分子量靶标筛选适配体,应用范围涵盖生物传感器技术、抗肿瘤药物发现等。首个适配体药物 Macugen 于 2004 年获 FDA 批准用于临床,此后已有十余种适配体药物处于不同阶段临床试验。从药...
Frontiers in chemistry
2016
Pfeiffer F, Mayer G
小分子在人体生理过程以及药物、毒素和化学品中发挥重要作用,因此检测与定量小分子的工具需求很高。本综述系统概述了能够识别小分子的适配体及其筛选方法,重点讨论该领域的现状、优势、存在问题及可能解决方案。文章回顾了系统进化指数富集(SELEX)技术用于小分子靶标时面临的限制,包括靶标固定化导致相互作用位点减少、溶液结合能力不足、亲和测定方...
Frontiers in chemistry
2016
Ruscito A, DeRosa MC
适配体是单链合成寡核苷酸,可折叠成三维结构,以高亲和力和特异性非共价结合靶分子。它们通过体外系统进化指数富集(SELEX)获得,经筛选和表征后用于治疗、生物传感等多种应用。本综述聚焦毒素、抗生素、分子标志物、药物和重金属等小分子靶标适配体。准确检测这些分子对保障人和动物健康至关重要,但小分子靶标分子量低,且与寡核苷酸尺寸差异显著,使...
Methods (San Diego, Calif.)
2016
Yang KA, Pei R, Stojanovic MN
本文报道了一种用于小分子适配体传感器的体外筛选与扩增协议。作者优化了基于结构切换(structure-switching)的 SELEX 方法,可直接获得小分子适配体传感器。该方法无需化学修饰目标小分子,而是在溶液相中使用天然状态目标;通过生物素化捕获链将寡核苷酸文库固定于链霉亲和素琼脂糖柱上,目标结合诱导文库构象切换并使其从柱上洗...
Talanta
2016
Wang H, Cheng H, Wang J, Xu L 等 6 人
为开发简便、低成本、快速且高特异性检测镉离子(Cd(II))的点亮型生物传感器,作者采用基于目标诱导释放链的改进体外筛选方法,从含30个随机碱基的单链DNA文库中分离Cd(II)特异性适配体。圆二色性(CD)光谱表明,筛选所得适配体Cd-2-1在加入Cd(II)后发生显著构象变化。进一步将适配体优化为30 nt的Cd-2-2,并在5...
ACS combinatorial science
2016
Valenzano S, De Girolamo A, DeRosa MC, McKeague M 等 7 人
适配体是可通过折叠形成三级结构、以高亲和力和高特异性结合靶标的合成单链 DNA 或 RNA 序列。本文报道了首次通过体外选择(SELEX)筛选并鉴定能够识别生物胺酪胺的 DNA 适配体。针对小分子靶标选择困难的问题,作者对 SELEX 策略进行系统改良,通过负选择、反选择、逐步缩短孵育时间、改变洗脱条件并增加选择轮次来提高选择严格性...
Applied biochemistry and biotechnology
2016
Mozioglu E, Gokmen O, Tamerler C, Kocagoz ZT 等 5 人
结核病仍是全球重大公共卫生问题,2011 年约有 900 万新发病例和 140 万死亡。为控制结核及其他传染病,世界卫生组织推荐 ASSURED 诊断工具,即经济、敏感、特异、易用、快速稳健、无需设备并可送达终端用户。适配体有望用于结核即时诊断。本研究采用指数富集系统进化(SELEX)筛选可识别结核分枝杆菌 H37Ra 的单链 DN...
Journal of visualized experiments : JoVE
2015
Martin JA, Smith JE, Warren M, Chávez JL 等 6 人
小分子因作为人体健康与机能状态生物标志物而成为生物传感的重要目标。核酸适配体已越来越多地用作生物传感器识别元件,但面向小分子目标选择适配体需要特殊设计。本文描述了一种用于筛选小分子结构转换适配体的方法及其关键步骤。DNA文库与固定在磁珠上的互补DNA捕获探针杂交,目标分子诱导结合序列发生构象变化,使其从磁珠上解离进入上清,从而与非结...
Biosensors & bioelectronics
2015
Eissa S, Siaj M, Zourob M
短毒素(BTXs)是一类强效海洋神经毒素,近十年地理分布扩大,可引发神经性贝类中毒(NSP)。现有海洋毒素检测方法存在伦理问题和操作难度,因此需要适合监管监测的替代方法。本文报道了一种用于检测短毒素-2(BTX-2)的电化学生物传感器平台,以 DNA 适配体作为特异性识别元件。作者首次通过体外系统进化指数富集(SELEX)从随机序列...
Analytical chemistry
2015
Contreras Jiménez G, Eissa S, Ng A, Alhadrami H 等 6 人
人体因激素治疗、食品或饮用水过量摄入孕酮(P4)可能导致不良健康效应,因此需在环境和临床样品中简便准确测定 P4。本研究筛选、鉴定并表征了高亲和力结合 P4 的单链 DNA 适配体。适配体自 1.8×10^15 条寡核苷酸文库经体外筛选获得,解离常数(KD)处于低纳摩尔范围;最佳适配体 P4G13 的 KD 经电化学阻抗谱(EIS)...
The Journal of steroid biochemistry and molecular biology
2015
Vanschoenbeek K, Vanbrabant J, Hosseinkhani B, Vermeeren V 等 5 人
适配体是具有特定三维结构的短合成单链 DNA 或 RNA 分子,是生物传感器中有前景的识别元件。通过指数富集系统进化配体(SELEX)过程,可在体外获得对多种分析物高灵敏、高特异的适配体。本研究旨在选择两组单链 DNA 适配体,使其均能结合 17β-雌二醇(E2)环戊烷多氢菲环上的不同功能基团。通过反复交替以 E2 正选、诺龙(no...
Talanta
2015
Wang S, Liu J, Yong W, Chen Q 等 8 人
四环素(TC)是常用于预防和控制动物疾病的广谱抗菌药物,食品中TC残留日益受到关注,需要高效分析技术进行食品质量评估。生物传感器因可满足传统方法难以实现的部分需求,成为食品安全分析中的有前景工具。本研究开发了一种新型比色适配体传感器,用于蜂蜜中TC的灵敏检测。该传感器基于改进的直接竞争酶联适配体检测(dc-ELAA)方案,采用经指数...
BioImpacts : BI
2014
Saberian-Borujeni M, Johari-Ahar M, Hamzeiy H, Barar J 等 5 人
纳米尺度适配体(Aptamers, Aps)是短单链 DNA 或 RNA 寡核苷酸,可高亲和力特异性结合靶标,因而被视为强效诊断与分析传感工具,即适配体传感器。适配体通过系统进化指数富集(SELEX)从随机寡核苷酸库中筛选获得。本文综述并讨论适配体传感器领域最新研究,重点探讨其多分析物检测潜力。由于适配体在分析物存在下具有特异性折叠...
Mikrochimica acta
2014
Wu J, Zhu Y, Xue F, Mei Z 等 11 人
系统进化指数富集配体(SELEX)技术于1990年提出,已成为识别和筛选适配体的重要工具。适配体是一类短寡核苷酸,能以高选择性和高亲和力识别并结合相应靶标,因而成为传统抗体的有吸引力替代品,尤其具有更稳定的优势。同时,适配体在食品质量与安全管理等不同领域得到广泛应用。本综述首先介绍SELEX的筛选过程及其发展演变,随后总结适配体在食...
Analytical chemistry
2014
Elshafey R, Siaj M, Zourob M
淡水蓝藻毒素柱孢藻毒素(CYN)污染对公共健康构成重大威胁,亟需灵敏检测方法。本文报道一种新型高灵敏、无标记阻抗适配体传感器用于 CYN 分析。作者采用 SELEX 从随机 DNA 文库中筛选出与 CYN 高亲和结合的 DNA 适配体,其解离常数 Kd 达纳摩尔级。其中 CYN9 适配体在结合 CYN 后发生明显构象变化,经圆二色性...
Chemical communications (Cambridge, England)
2014
Nguyen VT, Kwon YS, Kim JH, Gu MB
本文报道一种简单、快速、高通量的小分子适配体筛选方法——简单多 GO-SELEX。该方法利用氧化石墨烯(GO)作为无固定靶标的筛选平台,先以反靶标去除随机单链 DNA 文库中的非特异性序列,再让 GO 吸附 ssDNA,随后加入 tebuconazole、inabenfide 和 mefenacet 三种农药混合物,使与靶标结合的适...
Biosensors & bioelectronics
2014
Kim CH, Lee LP, Min JR, Lim MW 等 5 人
土霉素(oxytetracycline, OTC)是用于控制动物疾病的常用抗菌药物,其滥用可能危害人类健康。本研究开发了一种基于单链 DNA(ssDNA)适配体的生物传感器,用于检测 OTC。通过系统进化指数富集配体(SELEX)筛选 OTC 结合探针适配体,并用酶联适配体检测(ELAA)鉴定其结合特性。在筛选得到的 5 个适配体中...
Analytica chimica acta
2013
Huang L, Yang X, Qi C, Niu X 等 8 人
为开发用于鸦片生物碱可待因(codeine)检测的传感方法,作者采用系统进化指数富集(SELEX)技术从随机 DNA 文库中筛选可待因结合 DNA 适配体。经 19 轮筛选、克隆测序及截短突变优化,获得 37 碱基序列 HL7-14,其平衡解离常数 Kd 为 0.91 μM。竞争结合实验表明,HL7-14 对可待因具有较高特异性,对...