Enhanced Detection of
哈维氏弧菌是水产养殖中严重病原菌，可感染鱼、无脊椎动物和虾，也可经食物和水传播给人，造成公共卫生威胁，因此快速准确检测对防控重要。本研究以哈维氏弧菌粗胞外基质（CEM）为目标，采用指数富集系统进化配体（SELEX）技术，对未修饰DNA文库进行9轮体外筛选，获得两个高活性、高特异性DNA酶DVh1和DVh3。在此基础上构建了双DNA酶...
Aptamer-Based Sensor for Rapid and Sensitive Detection of Ofloxacin in Meat Products.
氧氟沙星（OFL）因价格低、抗菌谱广而广泛用于畜牧和水产养殖，但其降解慢、易在动物源性食品中残留，威胁人体健康。本研究开发了一种用于肉制品中OFL残留检测的简单高效方法。首先通过酰胺化反应将OFL偶联到氨基磁珠上，作为固定相；随后利用指数富集（SELEX）技术筛选出对OFL具有高亲和力和特异性的适配体AWO-06。以AWO-06为探...
Capture-SELEX for a short aptamer for label-free detection of salicylic acid.
水杨酸（SA）是阿司匹林的水解产物和活性形式，广泛存在于多种水果及其他食品中，食品与药物分析领域对其检测需求强烈。由于 SA 是小分子，适配体相比抗体更具优势。本研究采用文库固定化捕获-SELEX 方法筛选 SA 适配体。经 17 轮筛选，获得两个主要适配体家族。其中家族 1 的 SA1 适配体在硫黄素 T（ThT）荧光法中 Kd ...
Salt-Toggled Capture Selection of Uric Acid Binding Aptamers.
尿酸（UA）是人体内嘌呤代谢的终产物，也是多种疾病的重要生物标志物。此前为检测尿酸而筛选出一种尿酸结合适配体，但该适配体需要多个Mg2+离子才能结合；其有效结合需在约100 mM Mg2+下实现，而在生理条件下结合明显减弱。本研究采用交替更换Na+/Mg2+缓冲液的“盐切换”捕获筛选策略，经12轮筛选获得新的尿酸结合适配体SSV12...
On-site detection of fish furunculosis by combining DNAzyme and carboxyl-functionalized graphene.
鱼溃疡病由杀鲑气单胞菌（Aeromonas salmonicida）引起，可致鲑科、鲤科等鱼类败血症并快速死亡。本研究针对该菌，通过指数富集系统进化配体（SELEX）技术筛选 DNAzyme，获得 5 条富集率最高的候选序列，富集率分别为 34.78%、23.60%、8.91%、2.89% 和 2.34%。其中活性最高的 D-AS-...
Label-free and Dye-free Fluorescent Sensing of Tetracyclines Using a Capture-Selected DNA Aptamer.
四环素类是一类具有共同四环骨架的重要抗生素，目前多用于动物，但其向环境泄漏及食品残留引发健康担忧。适配体是检测四环素类的有吸引力方法，此前报道的适配体均通过固定靶分子获得。本研究以土霉素（OTC）为靶标，采用固定 DNA 文库的捕获 SELEX 策略筛选 DNA 适配体，获得与已有序列无重叠的新适配体。代表性序列 OTC5 经等温滴...
Selection of a metal ligand modified DNAzyme for detecting Ni
镍是重要金属，其生物传感检测长期是分析难题。DNA 已广泛用于金属检测，但此前未见用于 Ni2+ 的 DNA 传感器。DNAzyme 是 DNA 催化剂，可招募金属离子参与催化。本研究以含 50 个随机核苷酸区域的文库，在 Ni2+ 存在下进行体外选择 RNA 切割 DNAzyme。为提高 Ni2+ 结合能力，在切割位点插入甘氨酰-...
In vitro selection of CD70 binding aptamer and its application in a biosensor design for sensitive detection of SKOV-3 ovarian cells.
本研究通过系统进化指数富集（SELEX）技术筛选识别肿瘤细胞表面过表达分子 CD70 的单链 DNA 适配体。研究同时采用纯化 CD70 蛋白和表达 CD70 的细胞作为靶标，先进行 10 轮蛋白 SELEX，再进行 7 轮细胞 SELEX，最终获得对 CD70 具有高亲和力和高特异性的适配体 Apt928。实验表明，Apt928 ...
An in Vitro-Selected DNAzyme Mutant Highly Specific for Na
钠是生物体系中最常见的金属离子之一，但基于DNA的钠探针直到近期才被报道。NaA43是一种仅由Na+激活的Na+特异性RNA切割DNAzyme。本研究以六氨合钴(III)（Co(NH3)63+）作为预期金属辅因子进行体外筛选，却获得NaA43的突变体NaH1，二者仅相差两个核苷酸。NaA43的最适pH为7.0，而NaH1的最适pH为...
Magnetic Separation-Based Multiple SELEX for Effectively Selecting Aptamers against Saxitoxin, Domoic Acid, and Tetrodotoxin.
本研究提出一种基于磁分离的多重系统进化指数富集（SELEX）策略，用于同时筛选针对三种海洋生物毒素——膝孔酸（DA）、石房蛤毒素（STX）和河豚毒素（TTX）的单链DNA适配体。作者制备了磁性还原氧化石墨烯（MRGO），利用其对未结合单链DNA的吸附作用简化分离步骤。经过前12轮混合目标筛选和随后4轮单目标筛选，对三个富集ssDNA...
Selection of DNA aptamers to Streptococcus pneumonia and fabrication of graphene oxide based fluorescent assay.
肺炎球菌是全球感染性疾病的重要病原菌，尤其在儿童、老年人和免疫缺陷患者中危害严重，且抗生素耐药肺炎链球菌日益增多，因此需要简单、快速、特异的检测方法。本研究采用细菌系统进化指数富集（SELEX）技术，以活菌为靶标筛选出可特异性识别肺炎链球菌（Streptococcus pneumoniae）的DNA适配体，并将其整合到氧化石墨烯（G...
Development and characterization of DNA aptamers against florfenicol: Fabrication of a sensitive fluorescent aptasensor for specific detection of florfenicol in milk.
本研究利用基于磁珠的系统进化指数富集（SELEX）技术，从富集核苷酸文库中筛选出针对抗生素氟苯尼考（FF）的特异性单链DNA适配体。经过12轮筛选获得36条序列，并按一级序列相似性分为5个主要家族。对来自不同家族的3个荧光标记适配体进行结合亲和力分析，其解离常数（Kd）处于低纳摩尔范围（52.78–211.4 nmol L−1）。在...
In vitro selection and amplification protocols for isolation of aptameric sensors for small molecules.
本文报道了一种用于小分子适配体传感器的体外筛选与扩增协议。作者优化了基于结构切换（structure-switching）的 SELEX 方法，可直接获得小分子适配体传感器。该方法无需化学修饰目标小分子，而是在溶液相中使用天然状态目标；通过生物素化捕获链将寡核苷酸文库固定于链霉亲和素琼脂糖柱上，目标结合诱导文库构象切换并使其从柱上洗...
Selection and characterization of DNA aptamers for the development of light-up biosensor to detect Cd(II).
为开发简便、低成本、快速且高特异性检测镉离子（Cd(II)）的点亮型生物传感器，作者采用基于目标诱导释放链的改进体外筛选方法，从含30个随机碱基的单链DNA文库中分离Cd(II)特异性适配体。圆二色性（CD）光谱表明，筛选所得适配体Cd-2-1在加入Cd(II)后发生显著构象变化。进一步将适配体优化为30 nt的Cd-2-2，并在5...