Leukemia research
2018
Anderson E, Mehta P, Heywood J, Rees B 等 9 人
CPX-351 是将阿糖胞苷(ara-C)与柔红霉素(DNR)按 5:1 摩尔比共包封的脂质体制剂,在新诊断老年高危急性髓系白血病(AML)中显示良好疗效。本研究评估人永生化白血病细胞系和原代 AML 原始细胞体外暴露于 CPX-351 后的细胞内 ara-CTP 水平,并考察氟达拉滨对 CPX-351 生成 ara-CTP 的增强...
Journal of biotechnology
2018
Schirmer C, Posseckardt J, Kick A, Rebatschek K 等 9 人
近年来,基于遗传改造报告细胞的传感器被用于连续在线水质监测。本文报道了一种新型流通式微流控装置的设计、组装与性能,该装置固定了经遗传改造的酿酒酵母细胞;当受到双氯芬酸刺激时,酵母表达荧光蛋白,其荧光强度由荧光显微镜检测。尽管已有多种固定细胞检测不同分析物的装置,但本系统的创新在于能够安全封闭传感器细胞,从而获得不因细胞流失而失真的荧...
Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry
2018
Li H, Wei X, Gu C, Su K 等 7 人
奥拉毒素(OA)和河豚毒素(STX)分别是腹泻性贝类中毒(DSP)和麻痹性贝类中毒(PSP)的典型海洋毒素,对人类健康和环境安全构成严重威胁。OA是丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶的强效抑制剂,可诱导细胞死亡;STX是钠通道抑制剂,可导致神经损伤。本研究提出一种双功能心肌细胞基混合生物传感器,通过实时监测心肌细胞活力与电生理特性,同时检测D...
Bioorganic & medicinal chemistry
2018
Ding T, Li T, Li J
荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)是冷藏生乳和水产品腐败的主要革兰阴性嗜冷菌。群体感应(QS)通过自诱导物监测细菌密度并调控铁载体分泌、群游运动、生物膜形成等生理活动,因此寻找群体感应抑制剂(QSI)是控制食品腐败的潜在策略。本研究以中药数据库为来源,筛选低毒 QSI。通过全基因组测序获得 P. fluo...
ACS synthetic biology
2018
Jang S, Jang S, Noh MH, Lim HG 等 5 人
遗传电路由输入、逻辑和输出部件组成,复杂电路的构建需要大量可调遗传部件。然而,输入部件多样性有限且调谐复杂,限制了遗传电路的可扩展性。本文开发了一种RNA-蛋白质杂合输入部件,将核糖开关与正交转录抑制子组合。该杂合输入能够响应核糖开关识别的输入信号并调控输出转录,同时由于转录抑制子的表达实现信号反转。通过改变启动子强度,可方便地调节...
Nature communications
2018
Juárez JF, Lecube-Azpeitia B, Brown SL, Johnston CD 等 5 人
细菌能够感知环境中特定分子并触发相应代谢反应,是重要的生物技术资源。尽管许多介导该过程的转录因子(TF)已被研究,但仅少数被用于分子生物学应用。为扩展具有生物技术价值的生物传感器库,本文提出一种构建和测试嵌合 TF 库的策略,其核心是将高溶解性周质结合蛋白(PBP)与 DNA 结合域(DBD)融合,形成可识别小分子并调控转录的嵌合调...
Journal of food science and technology
2018
Li T, Yang B, Li X, Li J 等 6 人
水产品腐败主要由细菌生长引起,特定腐败菌(SSO)起重要作用。群体感应(QS)是微生物细胞间通讯系统,与种群密度协调,革兰氏阴性菌以 N-酰基高丝氨酸内酯(AHLs)为信号。本研究从有氧冷藏比目鱼中分离 SSO 荧光假单胞菌 PF-04,利用生物传感器 Chromobacterium violaceum CV026 检测 PF-04...
ACS synthetic biology
2018
Brandsen BM, Mattheisen JM, Noel T, Fields S
工程化微生物以监测环境化学物质或生产目标生物产品通常依赖合适的生物传感器,但将配体结合蛋白转化为生物传感器较为困难。本文报道了一种在大肠杆菌中构建生物传感器的一般策略:利用配体依赖性稳定转录激活蛋白,实现报告基因表达随配体浓度变化。作者以 LacI 作为配体结合域,将其与 Zif268 DNA 结合域和 RNA 聚合酶 ω 亚基 R...
Cell chemical biology
2018
Enam F, Mansell TJ
人乳低聚糖(HMOs)是重要的益生元复杂碳水化合物,对新生儿肠道微生物群具有多种益处。然而,其生物合成优化受限于单糖组成和糖苷键分析通量较低。为实现 HMO 结构的高通量筛选,作者构建了基于大肠杆菌的全细胞生物传感器,通过异源表达具有高度糖苷键特异性的糖苷酶,将目标 HMO 水解并释放乳糖核心,进而激活 lac 操纵子并驱动绿色荧光...
FEMS microbiology letters
2018
Jia X, Zhao T, Liu Y, Bu R 等 5 人
为提升全细胞铅生物传感器的性能,作者基于Cupriavidus metallidurans CH34的铅抗性操纵子pbr,通过重新配置调控元件并引入正反馈回路,设计了六种基因回路。pbr操纵子包含pbrRT和pbrABCD两组基因,PbrR结合其分歧启动子;铅离子存在时,PbrR构象变化并激活转录。研究以PbrR、分歧启动子和GFP...
Journal of biochemistry
2018
Aye SL, Fujiwara K, Doi N
本文提出一种用于筛选砷响应转录调控因子的正负双选择系统。首先,作者构建了以大肠杆菌 BL21(DE3) 为宿主、以 ArsR 转录调节蛋白和 GFP 报告基因为核心的全细胞生物传感器,用于检测液相样品中的亚砷酸盐 As(III)。该传感器采用双质粒系统:pET29-arsR 在 T7 启动子控制下表达 ArsR,pACYC-gfp ...
Photochemistry and photobiology
2018
Tienaho J, Poikulainen E, Sarjala T, Muilu-Mäkelä R 等 6 人
紫外线辐射(UV-R)可造成皮肤基因毒性和光老化,防晒霜常用于减轻损伤,但其中合成屏蔽剂可能带来环境危害。天然来源物质有望替代有害防晒化学品,但大量样品筛选繁琐,且常需单独进行基因毒性评估。本文报道一种基于重组大肠杆菌 DPD2794 生物传感器的微孔板技术,用于筛选紫外线防护物质。该菌携带 recA'::lux 报告系统,可在 D...
ACS synthetic biology
2018
Yoo JI, O'Malley MA
膜蛋白在生物技术中具有重要价值,但高产量功能性膜蛋白的制备困难限制了其在合成生物学中的应用。例如,G蛋白偶联受体(GPCR)用于全细胞生物传感器时,受限于其在所选宿主细胞表面功能性表达,可检测分子范围有限。本文提出一种简便方法,仅通过改变表达载体即可显著提高酿酒酵母中功能性膜蛋白的产量与均一性。以人腺苷A2a受体为模型,使用常用着丝...
Science (New York, N.Y.)
2018
Mimee M, Nadeau P, Hayward A, Carim S 等 15 人
胃肠道内生物分子监测有望实现疾病的快速精准诊断与管理,但受限于远端复杂环境难以直接获取。本文提出一种可吞咽微生物电子器件(IMBED),将环境耐受性生物传感细菌与微型化发光读出电子集成,并通过无线方式与外部设备通信。作为概念验证,作者构建了血红素敏感的益生菌生物传感器,用于检测红细胞裂解释放的血红素,并在猪模型中实现胃肠道出血的准确...
Molecular genetics and genomics : MGG
2018
Zhou Y, Memelink J, Linthorst HJM
水杨酸(SA)是植物发育和诱导防御中重要的激素。在拟南芥中,SA 主要经 chorismate 由异 chorismate 合酶(ICS)和推测的异 chorismate 丙酮酸裂解酶(IPL)介导生成,但迄今尚未鉴定出具有 IPL 活性的植物酶。本研究构建了一种基于大肠杆菌的 SA 全细胞生物传感器 XL1-LUX,将来自 Aci...
Frontiers in microbiology
2018
Miguez AM, McNerney MP, Styczynski MP
本文以大肠杆菌为微生物工厂,利用精确代谢工程构建可生产番茄红素(lycopene)的工程菌株,用于低成本诊断生物传感器的背景研究。为增加前体供应,作者异源表达甲羟戊酸途径。结果表明,同时诱导番茄红素合成途径与甲羟戊酸途径可提高番茄红素产量,但若在诱导番茄红素途径之前先诱导甲羟戊酸途径,则同时降低番茄红素产量和生长速率。作者建立了改进...
Metabolic engineering communications
2018
Jha RK, Bingen JM, Johnson CW, Kern TL 等 9 人
稳健的荧光型生物传感器已成为合成生物学中高通量菌株改良的关键工具。许多传感器在大肠杆菌等模式生物中开发,但工业微生物常具有目标工艺所需的优势表型,传感器跨宿主转移时可能出现灵敏度与动态范围下降。本文展示了一种通用策略,通过调节启动子中蛋白-DNA界面和蛋白二聚体界面,将基于邻苯二甲酸(PCA)的转录因子生物传感器从大肠杆菌优化到芳香...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2018
Holowko MB, Poh CL
在构建和表征用于霍乱弧菌检测的全细胞生物传感器过程中,作者采用两种核心技术:利用Gibson等温组装反应组装PCR扩增的质粒片段(DNA parts),并利用微孔板荧光读数对工程化大肠杆菌菌株进行表征。总体流程为:先在计算机中设计DNA片段,再通过等温组装构建质粒,随后转化至大肠杆菌,最后使用微孔板读数仪评估菌株表现。由于传感器设计...
Frontiers in neuroscience
2018
DeVos SL, Corjuc BT, Oakley DH, Nobuhara CK 等 11 人
阿尔茨海默病以神经元内过度磷酸化tau聚集体形成的神经原纤维缠结和细胞外淀粉样β斑块为特征,tau病理沿Braak分期在脑内扩散。作者利用稳定表达tau重复域P301S突变并融合CFP/YFP的HEK293 TauRD-P301S-CFP/YFP全细胞生物传感器,检测人脑裂解液中具有种子活性的聚集tau。结果显示,在仅有极少神经原纤...
Applied microbiology and biotechnology
2018
Zhang C, Parrello D, Brown PJB, Wall JD 等 5 人
本研究构建了一种新型铜绿假单胞菌 PAO1 全细胞生物传感器,用于非侵入性、同时监测其体内 las、rhl、pqs 和 iqs 四个群体感应(QS)网络的基因表达。该传感器以 PAO1 为宿主,携带 pSEVA-QSGEF 质粒,将 lasI、rhlI、pqsA 和 ambB 的启动子分别连接 Turbo YFP、mTag BFP2...