7 条结果 关键词:分子对接 ×

A novel fluorescent probe, triphenylamine rhodamine-3-acetic acid (mRA) for the detection of Amyloid-β aggregates in Alzheimer's disease.

Frontiers in neuroscience 2025 Chinnappan R, Khan MA, Mohammad T, Allwaibh SM 等 9 人

淀粉样蛋白β(Aβ)参与阿尔茨海默病(AD)病理生理过程,并在神经元退变中发挥重要作用。在溶液中的Aβ对筛选影响Aβ纤维化的先导化合物至关重要,Aβ肽在溶液中的错误折叠倾向与AD病因相关,因此Aβ的早期检测是AD诊断和常规临床评估的关键基础。本研究采用聚集诱导荧光探针三苯胺罗丹明-3-乙酸(mRA)检测Aβ聚集体。荧光结果表明mRA...

Computation-guided transcription factor biosensor specificity engineering for adipic acid detection.

Computational and structural biotechnology journal 2024 Pham C, Stogios PJ, Savchenko A, Mahadevan R

基于转录因子(TF)的小分子生物传感器可将配体识别与荧光等读出相偶联,是合成生物学中有用的工具,但可用于目标分子的已表征 TF 有限。本研究提出一种基于分子对接的计算工作流,用于定向改变 TF 的配体特异性。作者以 LysR 家族 TF BenM 为对象,通过计算筛选获得单个氨基酸替代位点,将其天然配体 cis,cis-粘康酸(CC...

Bisindolylmaleimides New Ligands of CaM Protein.

Molecules (Basel, Switzerland) 2022 Sosa-Peinado A, Fructuoso-García K, Vásquez-Bochm LX, González-Andrade M

本研究报道了一类双吲哚马来酰亚胺(Bisindolylmaleimides, BIMs)化合物作为钙调蛋白(calmodulin, CaM)潜在抑制剂的分子水平相互作用。BIMs 是源自斯他唑星(staurosporine)的药物原型,其中 BIM II、IV、VII、X 和 XI 首次被提出并报道为可能的 CaM 抑制剂。研究采用...

Discovery of Specific Nonpeptide Probe for Chymotrypsin via Molecular Docking-Based Virtual Screening and the Application.

ACS applied bio materials 2018 Xiong H, Li RR, Liu SY, Wu FX 等 6 人

糜蛋白酶(chymotrypsin)是一种与多种生物过程相关的蛋白酶,并显著参与胰腺疾病发生,因此其快速灵敏检测对早期诊断和相关药物发现具有重要意义。本文发展了一种基于分子对接的虚拟筛选(MDVS)策略,用于鉴定靶向糜蛋白酶的新型非肽生物传感器。新发现的探针20对糜蛋白酶相对于相似酶胰蛋白酶具有约45倍特异性,并在糜蛋白酶催化下产生...

A selective, long-lived deep-red emissive ruthenium(II) polypyridine complexes for the detection of BSA.

Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy 2014 Babu E, Muthu Mareeswaran P, Singaravadivel S, Bhuvaneswari J 等 5 人

本研究报道了一种基于钌(II)多吡啶配合物的选择性、无标记发光传感器,用于检测牛血清白蛋白(BSA),并考察其相对于其他蛋白质的识别能力。作者采用紫外-可见吸收、稳态发射、激发态寿命和圆二色(CD)光谱技术研究了 BSA 与两种 Ru(II) 配合物(I 和 II)之间的相互作用。加入 BSA 后,配合物 I 和 II 的发光强度分...

Importance of the interaction protein-protein of the CaM-PDE1A and CaM-MLCK complexes in the development of new anti-CaM drugs.

Journal of molecular recognition : JMR 2013 González-Andrade M, Mata R, Madariaga-Mazón A, Rodríguez-Sotres R 等 6 人

蛋白-蛋白相互作用在生理和病理过程中起核心作用,理解其机制有助于发现新治疗靶点。本研究以钙调蛋白(CaM)、人源钙/钙调蛋白依赖性30,50-环核苷酸磷酸二酯酶1A(PDE1A)、肌球蛋白轻链激酶(MLCK)以及αII-谱蛋白肽(aII-spec)和两种CaM抑制剂氯丙嗪(CPZ)与malbrancheamide(MBC)为对象,利...

Fluorescence, circular dichroism, NMR, and docking studies of the interaction of the alkaloid malbrancheamide with calmodulin.

Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry 2011 Figueroa M, González-Andrade M, Sosa-Peinado A, Madariaga-Mazón A 等 7 人

从真菌 Malbranchea aurantiaca 的生物碱部分,作者以较高收率分离得到新类似物 isomalbrancheamide B(3)及已知化合物 malbrancheamide(1)、isomalbrancheamide(2)和 premalbrancheamide(4)。采用酶学、荧光、圆二色、核磁共振和分子模拟方法...