RNA-based fluorescent biosensors for live cell detection of bacterial sRNA.
细菌含有多种 RNA，用于在环境刺激下紧密调控基因表达。细菌小 RNA（sRNA）与蛋白辅因子协同结合互补 mRNA，从而上调或下调蛋白合成。sRNA 的活体成像有助于实时理解其时空动态，并为合成生物学和治疗应用提供新策略。目前 sRNA 成像方法在体内应用有限，无法提供 sRNA 水平波动的实时信息。本文报道了一种用于细菌 sRN...
Visualizing cellular heterogeneity by quantifying the dynamics of MAPK activity in live mammalian cells with synthetic fluorescent biosensors.
有丝分裂原活化蛋白激酶（MAPKs）通过将胞外信息转导为特定生物学反应，调控细胞生长、分化、应激适应和凋亡等多种功能。为理解这些通路的调控机制，需要在活体单细胞水平进行动态定量测量。荧光显微成像适合此类测量，但仍需更灵敏、动态范围更大的生物传感器。作者将酵母中合成的激酶活性转位传感器（SKARS）改造用于哺乳动物细胞，构建了可被人源...
Displacement Induced Off-On Fluorescent Biosensor Targeting IDO1 Activity in Live Cells.
本文展示大环主体葫芦[8]脲（CB[8]）与荧光染料二甲基二氮杂吖丙啶双阳离子（MP）自组装形成结合型生物传感体系，其空腔可同时捕获吲哚胺 2,3-双加氧酶 1（IDO1）的上游底物色氨酸（Trp），从而提供一种无标记、实时监测 IDO1 活性的方法。将过表达 IDO1 的恶性 HeLa 和 HepG2 细胞与该结合型生物传感器孵育...
Addendum: A FRET biosensor for necroptosis uncovers two different modes of the release of DAMPs.
本补充说明针对此前报道的用于坏死性凋亡（necroptosis）的 FRET 生物传感器进行更正。作者指出，原文章中所述的人源 SMART 生物传感器并不包含用于替代 MLKL 对应 a 区和 b 区的 SAGG 重复序列。在收到小鼠和人源 SMART cDNA 的请求后，作者发现人源 SMART 序列与人源 α15 完全相同，而 ...
High-throughput chemical screening to discover new modulators of microRNA expression in living cells by using graphene-based biosensor.
微小RNA（miRNA）是调控基因表达的重要非编码RNA，疾病相关miRNA表达调控对基础研究和治疗均具有重要意义。本文提出一种高通量筛选策略，用于在活细胞中鉴定调控miRNA表达的小分子。该策略基于由肽核酸（PNA）和纳米氧化石墨烯（NGO）组成的新型生物传感器，通过定量荧光信号实时监测活细胞内目标miRNA水平，并同时观察与mi...
In situ biosensor for detection miRNA in living cells based on carbon nitride nanosheets with catalytic hairpin assembly amplification.
本研究开发了一种基于碳氮化物纳米片（CNNS）和催化发夹组装（CHA）的超灵敏荧光开启型原位检测方法，用于检测活细胞内 microRNA（miRNA）。CHA 对低水平生物标志物具有良好的信号放大能力，CNNS 则可作为荧光猝灭剂和基因载体，且 CHA 的发夹 DNA 可吸附在 CNNS 表面。作者据此设计了一种无酶荧光生物传感器，...
Ultra-sensitive fluorescent sensor for intracellular miRNA based on enzyme-free signal amplification with carbon nitride nanosheet as a carrier.
本研究构建了一种用于活细胞内 microRNA（miRNA）监测的新型超灵敏荧光生物传感器。该传感器以碳氮化物纳米片（CNNS）为载体，利用杂交链式反应（HCR）实现无酶信号放大。Cy5 标记的发夹 DNA 探针可吸附于 CNNS 表面，由于 CNNS 对 Cy5 的强荧光猝灭作用，初始荧光被抑制。当存在互补 miRNA 时，miR...
Corrigendum: Fluorescence-tunable Ag-DNA biosensor with tailored cytotoxicity for live-cell applications.
本文为《Scientific Reports》2016年论文“Fluorescence-tunable Ag-DNA biosensor with tailored cytotoxicity for live-cell applications”的勘误。作者更正了引言和结果讨论中关于Ag-DNA模板设计或选择的表述，强调部分DNA序...
Activity Detection of GalNAc Transferases by Protein-Based Fluorescence Sensors In Vivo.
黏蛋白型O-糖基化是高尔基体中重要的蛋白质翻译后修饰，由多达20种GalNAc转移酶亚型启动，各亚型具有不同的底物特异性。该酶家族调控大量分泌途径蛋白，其失调与多种人类疾病相关。本文介绍一种在分泌途径中转运的蛋白基荧光传感器，用于在活细胞中监测GalNAc转移酶活性。传感器可设计为广谱（pan）或亚型特异性。其结构包含荧光激活蛋白（...
New DAG and cAMP Sensors Optimized for Live-Cell Assays in Automated Laboratories.
基于蛋白的荧光生物传感器可用于研究健康与疾病中的细胞信号转导，但在自动化实验室中的应用受到限制。作者开发了两种可在标准荧光酶标仪上稳定运行的活细胞检测体系，分别用于检测二酰甘油（DAG）和环磷酸腺苷（cAMP）。DAG 传感器采用 mNeonGreen 荧光蛋白与 DAG 结合域融合，经杆状病毒转导进入 HEK293T 细胞，在 G...
Multimodal optical sensing and analyte specificity using single-walled carbon nanotubes.
纳米传感元件有望在物理或生物受限环境中实现单分子分析物检测。单壁碳纳米管（SWNT）作为光学传感器具有光稳定近红外发射、可穿透生物介质及单分子灵敏度等优势。分子吸附可通过扰动纳米管电子结构转换为光学信号。本文证明一对 SWNT 物种（(6,5) 和 (7,5)）可提供至少四种可调制模式，通过分析物对发射带强度或波长的改变程度对试剂进...
Fluorescence resonance energy transfer-based assay for characterization of hepatitis C virus NS3-4A protease activity in live cells.
丙型肝炎病毒（HCV）NS3/4A 蛋白酶在病毒复制中起关键作用。本研究报道了一种用于在单个活哺乳动物细胞中监测该酶活性的荧光共振能量转移（FRET）探针。该探针由增强青色荧光蛋白（ECFP）与 citrine（增强黄色荧光蛋白变体）融合而成，二者之间的连接肽中嵌入 HCV NS3/4A 蛋白酶切割位点。在哺乳动物细胞中表达该生物传...
Mitogen-activated protein kinase p38 regulates the Wnt/cyclic GMP/Ca2+ non-canonical pathway.
非经典 Wnt/环磷酸鸟苷/钙离子/NF-AT 通路经由 G 蛋白偶联受体 Frizzled-2 发挥作用。作者在小鼠 F9 畸胎瘤胚胎细胞中扫描 Wnt5a 激活 Frizzled-2/Gβt2/PDE6 后的下游事件，发现丝裂原活化蛋白激酶 p38（MAPK p38）被强烈激活。p38 激活对 Frizzled-2 介导的 NF...