10 条结果 关键词:蛋白-DNA相互作用 ×

DNA-facilitated target search by nucleoproteins: Extension of a biosensor-surface plasmon resonance method.

Analytical biochemistry 2021 Vo TD, Schneider AL, Poon GMK, Wilson WD

为拓展生物传感器-表面等离子共振(biosensor-SPR)在核蛋白DNA识别研究中的价值,作者对两种ETS家族转录因子Elk1和ETV6的DNA促进靶标搜索进行了比较分析。ETS结构域因高度保守的DNA结合基序而具有多样的理化性质,适合发展基于生物传感器的技术。研究基于一种将蛋白以非特异复合形式定量捕获并呈现给固定化同源DNA的...

A Bit Stickier, a Bit Slower, a Lot Stiffer: Specific vs. Nonspecific Binding of Gal4 to DNA.

International journal of molecular sciences 2021 Carzaniga T, Zanchetta G, Frezza E, Casiraghi L 等 10 人

转录因子通过结合基因组DNA的特定区域调控基因活性,其选择性依赖于特异性与非特异性相互作用的精细平衡,但二者难以同时定量。本文利用反射幻影界面(Reflective Phantom Interface, RPI)——一种基于光学反射率的无标记生物传感器——研究酿酒酵母基因调控因子Gal4的N端结构域与含或不含有其共识序列的双链DNA...

Determination of cell metabolite VEGF₁₆₅ and dynamic analysis of protein-DNA interactions by combination of microfluidic technique and luminescent switch-on probe.

Biosensors & bioelectronics 2016 Lin X, Leung KH, Lin L, Lin L 等 8 人

本文合理设计了一种新型G-四链体选择性发光铱(III)配合物,用于在微流控体系中快速检测寡核苷酸和VEGF165。该探针具有G-四链体选择性,可实现快速、灵敏检测。该新探针被用作一种便捷的生物传感器,用于无标记定量分析细胞代谢产生的VEGF165蛋白,并且与微流控平台结合用于研究适配体–蛋白相互作用的动力学过程。基于流体聚焦和扩散混...

Quantitative Investigation of Protein-Nucleic Acid Interactions by Biosensor Surface Plasmon Resonance.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2015 Wang S, Poon GM, Wilson WD

生物传感器-表面等离子共振(Biosensor-SPR)技术已成为研究核酸相互作用的一种强大无标记实时方法。该方法可在低样品用量且无需外部探针的条件下,同时获得生物分子相互作用的平衡与动力学信息。本文提供了利用生物传感器-SPR方法分析蛋白-DNA相互作用的详细实用指南,系统介绍了SPR技术原理与基本基础,并对SPR仪器、传感芯片和...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 蛋白-DNA相互作用动力学分析稳态分析PU.1转录因子

New environment-sensitive multichannel DNA fluorescent label for investigation of the protein-DNA interactions.

PloS one 2014 Kuznetsova AA, Kuznetsov NA, Vorobjev YN, Barthes NP 等 7 人

本文报道了一种新型环境敏感多通道DNA荧光碱基类似物3-羟基色酮(3HC),用于评估其作为蛋白-DNA相互作用过程中结构转变荧光报告探针的适用性,并与市售2-氨基嘌呤(aPu)、吡咯胞嘧啶(Cpy)和1,3-二氮杂-2-氧代苯并噁嗪(tCO)进行比较。作者将荧光碱基类似物掺入DNA双螺旋中损伤核苷5,6-二氢尿嘧啶(DHU)的对侧或...

Probing the electrostatics and pharmacological modulation of sequence-specific binding by the DNA-binding domain of the ETS family transcription factor PU.1: a binding affinity and kinetics investigation.

Journal of molecular biology 2013 Munde M, Poon GM, Wilson WD

ETS 家族转录因子通过结构保守但序列多样的 ETS 域识别 DNA,调控多种基因。尽管 ETS–DNA 复合物的结构和热力学已有较多研究,序列识别动力学仍不清楚。作者采用生物传感器表面等离子共振(SPR)技术,表征 PU.1 ETS 域与 DNA 的结合。SPR 分析显示 PU.1 ETS 域具有独特的动力学特征:低盐条件下与高亲...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 PU.1ETS转录因子蛋白-DNA相互作用结合动力学

Solid-state nanopores for biosensing with submolecular resolution.

Biochemical Society transactions 2012 Bahrami A, Doğan F, Japrung D, Albrecht T

生物细胞膜含有多种1–100 nm的离子通道和跨膜孔,对细胞功能至关重要。1976年,Neher和Sakmann利用膜片钳技术证明单个通道可被电学探测。自20世纪90年代以来,该工作启发了蛋白纳米孔或固态纳米孔作为廉价、超快传感器用于检测DNA、RNA和蛋白质等生物分子,尤其聚焦DNA测序。固态纳米孔的优势在于孔径可按被测物定制,并...

Real-Time Analysis of Specific Protein-DNA Interactions with Surface Plasmon Resonance.

Journal of amino acids 2012 Ritzefeld M, Sewald N

转录因子等蛋白通过结合特定 DNA 序列调控决定细胞命运的生化通路,因此分析蛋白-DNA 相互作用及其作用机制至关重要。表面等离子共振(SPR)是一种无标记方法,可实时阐明生物分子相互作用的动力学。本文聚焦这一基于生物传感器的方法,系统介绍如何利用 SPR 研究蛋白与寡核苷酸的结合。文章首先描述 SPR 的物理现象及仪器实现,包括棱...

A nanoelectromechanical biosensor based on precise quantification and control of DNA orientation.

Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference 2011 Spuhler PS, Sola L, Zhang X, Monroe M 等 7 人

本文提出一种基于光谱自干涉荧光显微镜(SSFM)的纳米机电生物传感器,用于精确量化表面锚定双链DNA(dsDNA)的取向与构象。研究以二氧化硅(SiO2)表面为基底,采用新型两性三维聚合物支架进行功能化,并将胺功能化dsDNA探针端接于聚合物上。该聚合物等电点约为6.5,在pH高于6.5时带净负电,低于6.5时带净正电,从而通过静电...

Highly sensitive and reversible silicon nanowire biosensor to study nuclear hormone receptor protein and response element DNA interactions.

Biosensors & bioelectronics 2010 Zhang GJ, Huang MJ, Luo ZH, Tay GK 等 7 人

为深入理解雌激素受体(ER)在基因表达调控中的作用,必须表征雌激素受体与雌激素反应元件(ERE)之间的相互作用。本文报道了一种高灵敏、可重复使用的硅纳米线(SiNW)生物传感器,用于研究人 ERα 和 ERβ 亚型蛋白与双链 ERE 的相互作用。ER 蛋白通过硅烷化学共价固定于 n 型 SiNW 表面,随后将野生型、突变型和乱序型 ...