Nucleic acids research
2016
Jha RK, Kern TL, Kim Y, Tesar C 等 7 人
全细胞生物传感器利用转录因子(TF)可灵敏、选择性地检测特殊化学品或人为分子,但需要更多可用的 TF。本研究基于同源建模和配体对接识别结合口袋,并通过保守突变工程化 Acinetobacter 转录因子 PobR,使其能够识别对硝基酚(pNP),并通过 PobR 启动子驱动的荧光蛋白报告基因测量响应。在约 10^7 个 PobR 变...
Scientific reports
2016
Ji J, Gu W, Sun C, Sun J 等 7 人
在人类和动物暴露过程中,霉菌毒素常以混合物形式存在。本研究开发了一种基于HEK-293人胚胎肾细胞的荧光生物传感器,用于快速、简便地检测并评价由禾谷镰刀菌产生的常见食品污染物脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)和玉米赤霉烯酮(ZEN)。作者构建了TRE-copGFP和ERE-TagRFP重组质粒,并通过脂质介导的高效DNA转染方法共转染HE...
BioMed research international
2016
Sauer M, Altrichter J, Haubner C, Pertschy A 等 15 人
目的:粒细胞输注可用于治疗脓毒症免疫细胞功能障碍。本研究前瞻性评估含健康供体粒细胞的体外生物反应器治疗脓毒症时患者去甲肾上腺素剂量变化,以及对动态和细胞基肝功能检测的影响。方法:10例重症脓毒症患者72小时内接受两次治疗,监测生存、生理参数、扩展血流动力学和吲哚菁绿血浆清除率(PDR);治疗前后患者血浆用细胞基生物传感器分析肝毒性。...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2016
Gabriel GV, Viviani VR
本文介绍一种用于环境一般毒性检测的简单光关闭生物发光生物传感器。该传感器以工程化大肠杆菌 BL21(DE3) 为全细胞识别与换能元件,通过 pPro 质粒分别表达 Macrolampis sp2 萤火虫荧光素酶或 Pyrearinus termitilluminans 叩甲荧光素酶,并经 IPTG 诱导。诱导后的细菌可培养于液体中,...
BioMed research international
2016
Sombetzki M, Koslowski N, Doss S, Loebermann M 等 7 人
曼氏血吸虫严重肝脾损伤由 Th2 介导的针对困于门管周组织虫卵的肉芽肿反应引起,随后纤维化瘢痕形成和肝内门静脉变形/硬化导致门脉高压、腹水和食管静脉曲张。曼氏血吸虫小鼠模型可在合理时间内建立严重肝脾损伤,适用于开发抗纤维化或抗感染策略,但用于虫卵负荷、肉芽肿大小、肝炎症和纤维化复杂分析的材料有限,因为肝组织和血样量小。本研究旨在建立...
Yeast (Chichester, England)
2016
Malak A, Baronian K, Kunze G
Blastobotrys adeninivorans(同物异名 Arxula adeninivorans)是一种非传统、非致病、不完全、单倍体酵母,属于子门 Saccharomycotina,迄今受到较少关注。它具有耐热、耐渗透压和广底物利用谱等特性。培养温度不同可使其呈现不同形态,并伴随不同的翻译后修饰和蛋白表达特征,且与形态密切...
Journal of industrial microbiology & biotechnology
2016
Wang Y, Li Q, Zheng P, Guo Y 等 8 人
本研究提出一种利用 L-赖氨酸诱导型启动子进化大肠杆菌赖氨酸工业菌株的新方法。以该启动子控制的增强绿色荧光蛋白(EGFP)胞内表达水平为表型,从由 L-赖氨酸高产大肠杆菌菌株经诱变获得的 10^7 突变库中,通过流式细胞分选(FACS)初步筛选出 186 株。随后依据赖氨酸浓度、赖氨酸产率以及 96 深孔板中单位细胞产率等多参数对 ...
ACS synthetic biology
2016
Bi S, Pollard AM, Yang Y, Jin F 等 5 人
大多数细菌利用跨膜传感器检测多种环境刺激,其中趋化受体使运动细菌沿环境化学梯度定向运动。大肠杆菌的趋化受体对配体具有高度敏感响应,因而具有生物传感应用潜力;但大肠杆菌仅有四个配体结合趋化受体,天然配体谱有限。因此,设计新型化学受体以扩展大肠杆菌的传感能力是趋化生物传感器开发的关键。一条可行路径是利用细菌中丰富的天然化学传感功能,构建...
Scientific reports
2016
Wong RR, Kong C, Lee SH, Nathan S
毒素被认为在伯克霍尔德菌假单胞菌(Burkholderia pseudomallei)致病中起关键作用,但目前仅鉴定出少数毒性分子,主要受限于缺乏敏感毒性指示物。作者此前对感染该菌的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)进行全基因组转录组分析,发现多种编码解毒酶的宿主基因显著过表达,提示宿主试图清除细菌毒性分子...
PloS one
2016
Kecse-Nagy C, Szittner Z, Papp K, Hegyi Z 等 9 人
本研究检验免疫球蛋白在激活核因子-κB(NF-κB)通路介导的细胞反应方面是否存在差异,并考察免疫复合物性质(如抗体同种型与抗原结合比例)对这些反应的调节。常规免疫测定可分别检测不同免疫球蛋白类别和亚类的抗原特异性抗体,但无法反映这些抗体组合的净生物学效应。作者将携带Fc受体的单核样U937细胞系稳定转染NF-κB启动子驱动绿色荧光...
International journal of phytoremediation
2016
Bartolomé MC, Cortés AA, Sánchez-Fortún A, Garnica-Romo MG 等 6 人
本研究将淡水绿藻 Dictyosphaerium chlorelloides 野生型(Dcwt)在实验室逐步驯化,使其能在含镉 100 µM 的培养基中存活,获得镉抗性菌株 DcCdR100,并研究其形态与生理变化。将活细胞暴露于 100 µM Cd 30 天,检测镉去除能力;用光学显微镜测量细胞尺寸,分析生长、光合有效量子产率(Φ...
Applied and environmental microbiology
2016
Fernández M, Morel B, Ramos JL, Krell T
许多微生物的强金属抗性与其携带多个金属抗性操纵子有关。铜绿假单胞菌 KT2440 是研究此类微生物的模型,其砷抗性由两个同源砷抗性操纵子 ars1 和 ars2 编码的蛋白共同介导,两个操纵子分别含转录调控子 ArsR1 和 ArsR2。本文显示,纯化的 ArsR1 和 ArsR2 能以约 30 μM 的相似亲和力结合三价砷(亚砷酸...
Analytica chimica acta
2016
Gao G, Qian J, Fang D, Yu Y 等 5 人
由于多数毒物风险评估基于单种生物试验,外推到生态系统评价存在不确定性。本文开发了对苯醌介导的全细胞电化学生物传感器,将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母混合共固定,用于多污染物毒理学分析。该传感器评估了重金属离子(Cu2+、Cd2+)、3,5-二氯酚(DCP)和农药(Ametryn、Acephate)的单独及联合毒性。单毒物毒性顺序为...
ACS synthetic biology
2016
Rugbjerg P, Genee HJ, Jensen K, Sarup-Lytzen K 等 5 人
可预测地整合外源生物信号与元件仍是合成细胞执行系统工程的关键挑战,亟需提高信号转导与灵敏度的通用方法。为此,作者受化学 pH 缓冲体系启发,在酿酒酵母中建模并构建了一个分子信号缓冲网络。该网络对四环素响应核糖开关进行上下文隔离,使其能够合成控制菌落形成并实现模块化信号操纵。核糖开关信号被传递至分裂转录因子的转录激活域,而相互作用的 ...
Sensors (Basel, Switzerland)
2016
Hennig S, Rödel G, Ostermann K
小肽类如酵母信息素的检测与定量常具挑战性。作者基于重组疏水蛋白开发了一种高灵敏、稳健的亲和检测法,用于定量酿酒酵母 α-factor 信息素。I 类疏水蛋白 EAS 及其融合 α-factor 的衍生物 EAS-α 可在亲水-疏水界面自组装成稳定单分子层;将二者以不同比例功能化固相载体后,信息素特异性抗体可结合到表面暴露的 α-fa...
Biosensors & bioelectronics
2016
Jiang H, Jiang D, Zhu P, Pi F 等 8 人
本研究开发了一种新型细胞间电化学微流控芯片,用于食品过敏原的定性与定量分析。该装置可同步完成微流控细胞培养、食品过敏原诱导的细胞形态变化观察以及细胞代谢测量。研究采用 RBL-2H3 肥大细胞与 ANA-1 巨噬细胞构建细胞共培养模型,用于观察抗原刺激下的过敏应答。芯片包含两条细胞培养微流控通道,并集成四组金电极和一条附加“毛细管”...
Applied microbiology and biotechnology
2016
Wolf D, Mascher T
细胞包膜是细菌的关键结构,由质膜、细胞壁以及革兰阴性菌的外膜组成,也是抗生素尤其是抗菌肽的主要作用靶标。维持其完整性对细菌在竞争环境中生存至关重要。细菌常通过双组分系统(2CS)感知外部抗生素威胁或自身产生的抗生素,并诱导特定抗性基因表达。此类转录调控发生在特定靶启动子水平,这些启动子通常受到严格调控,仅在特定抗生素存在时被诱导,且...
Scientific reports
2016
Webb AJ, Kelwick R, Doenhoff MJ, Kylilis N 等 11 人
寄生虫病在全球造成重大健康负担,尤其在资源有限地区需要快速、低成本的检测方法。寄生虫在生命周期中常释放特异性蛋白酶,可作为检测标志物。本研究利用合成生物学策略,构建了模块化大肠杆菌和枯草芽孢杆菌全细胞生物传感器平台,将可互换的蛋白酶识别基序整合到细胞表面展示系统中。当靶标蛋白酶切割识别基序时,表位标签被移除,荧光探针无法结合,细胞出...
Journal of biological engineering
2016
Call TP, Akhtar MK, Baganz F, Grant C
近年来,开发用于烷烃生产、生物传感和生物修复的合成微生物平台受到关注,但控制烷烃进入宿主细胞的速率仍是关键问题,且天然转运组分尚不明确。本研究以假单胞菌 GPo1 的 AlkBGT 烷烃单加氧酶复合物作为报告系统,评估大肠杆菌中烷烃导入,并评价两种天然转运蛋白 FadL 和 OmpW 对辛烷的转运功能。结果显示,删除 fadL 后辛...
Biochemistry and molecular biology education : a bimonthly publication of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology
2016
Nievas FL, Bogino PC, Giordano W
阿根廷里奥夸尔托大学分子生物学系的生物化学课程面向生物学、微生物学、化学、农学和兽医学本科生。微生物学学生通常已修普通化学、分析化学和有机化学。通过程序化实验序列,学生可在其知识范围内探究可解决的生物化学问题。作者此前已设计并报道了一套帮助微生物学学生熟悉群体感应(QS)和群体淬灭(QQ)信号分子检测与表征技术的实验。本文描述了一套...