肿瘤坏死因子（TNF）在类风湿关节炎、克罗恩病等炎症和自身免疫疾病中起重要作用。TNF通过与TNFR1或TNFR2结合发挥效应，因此小分子疗法需选择性抑制TNFR1以避免副作用。近期，我们构建了时间分辨荧光共振能量转移（FRET）生物传感器，用于高通量筛选调节TNFR1构象的小分子，并鉴定出可抑制受体激活但效力较低的zafirluk...
G-四联体（G4）是由富含鸟嘌呤核酸序列形成的非经典二级结构，在端粒维持、转录和DNA复制等体内过程中发挥重要作用。G4主要有平行、反平行和混合三种拓扑构型，通常由K+、Na+等金属阳离子通过鸟嘌呤四联体中心配位而稳定。由于同一G4序列在不同环境条件下可形成不同构象，研究者开发了多种基于G4的传感器，且许多适配体折叠为G4结构，使其...
钼和钨以可溶性氧阴离子形式经细菌和古菌的高亲和 ATP 结合盒（ABC）转运系统摄取，其中组分 A（ModA/TupA）是细胞区分 MoO4^2−、WO4^2− 及其他相似氧阴离子的第一道选择门。本文报道了来自阿拉斯加脱硫杆菌 G20 的 apo-TupA 蛋白的生化表征及 1.4 Å 分辨率晶体结构。小角 X 射线散射（SAXS）...
RecD2 是参与 DNA 修复的单体细菌 I 超家族（SF1）解旋酶，但具有不同于多数 SF1 成员的 5'-3' 转位方向，其 ATPase 机制尚不清楚。本研究在单链 DNA（ssDNA）存在下测定 RecD2 ATPase 循环各步速率常数，并全程使用荧光 ATP 类似物 mantATP，以获得单一核苷酸物种的完整速率常数和...
周质结合蛋白（PBP）是革兰氏阴性菌ATP结合盒（ABC）输入系统的关键组分，其核心功能是在无配体开放构象与结合配体后闭合构象之间发生大规模构象重排，从而指示底物存在并启动跨膜转运。PBP不仅对营养摄取至关重要，也常作为生物传感器技术和别构机制研究的基础模型。尽管晶体学提供了静态原子结构，但溶液核磁共振（NMR）能够补充动态过程、构...
背景：此前发现一种源自葡萄球菌激酶（SAK）的合成十九肽 SP（GPYLMVNVTGVDGKGNELL）可增强 SAK/纤溶酶复合物对纤溶酶原的激活。目的：鉴定 SP 在纤溶酶原上的结合位点，并阐明 SP 对组织型纤溶酶原激活物（t-PA）激活纤溶酶原的影响。方法：采用比色底物法和还原条件 SDS-PAGE 检测纤溶酶原激活；用 I...
本研究以牛血清白蛋白（BSA）为模型蛋白，采用傅里叶变换红外光谱、荧光光谱、紫外-可见吸收光谱和圆二色谱，系统研究了纳米金刚石颗粒（ND）–BSA复合物中BSA的构象变化。光谱结果表明，尽管ND与BSA相互作用引起BSA发生一定构象改变，但复合物中BSA的大部分二级结构特征仍得以保留。进一步通过BSA吸附等温线和ζ电位测量考察了ND...
片段命中化合物向高亲和力先导化合物的优化是片段药物发现（FBDD）的关键环节。本研究通过片段生长策略，将苯甲酸酯取代去托品片段优化至乙酰胆碱结合蛋白（AChBP）结合位点中由配体诱导形成的亚口袋。AChBP 是半胱氨酸环受体配体结合域的可溶性同源蛋白。作者利用配体复合物 X 射线晶体结构、表面等离子共振（SPR）生物传感器分析和等温...
细胞迁移、吞噬和肌细胞融合过程中，细胞因子奉献蛋白（DOCK）作为鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）调控 Rac1/Cdc42 活性。吞噬与细胞运动蛋白（ELMO）可结合部分 DOCK 成员，并逐渐成为 Rac 信号的关键调控因子。尽管 DOCK180/ELMO 复合物的形成并非 Rac1 激活所必需，但无法结合 DOCK180 的 E...