Weak protein-bicelle binding quantification via surface-based DNA nanolevers.
为研究人类肌营养不良蛋白（dystrophin）如何与仿生磷脂双分子层（bicelles）结合，作者应用 switchSENSE® 荧光生物传感技术，在微流控环境中利用动态 DNA 纳米杠杆进行实时检测。该方法材料消耗少，可实现弱而瞬时相互作用的实时动力学分析，弥补经典生物物理方法难以捕捉低亲和力蛋白-脂质结合的不足。研究聚焦两个功...
Kinetic FRET Assay to Measure Binding-Induced Conformational Changes of Nucleic Acids.
小分子或蛋白质与 RNA/DNA 的相互作用常伴随核酸折叠和结构变化，对其生物物理表征有助于理解分子机制。本文提出 kinFRET（动力学 Förster 共振能量转移），一种实时整体 FRET 方法，用于测量结合与折叠动力学。kinFRET 基于 switchSENSE 生物传感技术，利用荧光标记的表面固定 DNA 连接链，在芯片...
Impact of the Coverage of Aptamers on a Nanoparticle on the Binding Equilibrium and Kinetics between Aptamer and Protein.
本文研究金纳米颗粒（AuNPs）表面适配体覆盖度对适配体与蛋白干扰素-γ（IFN-γ）结合平衡和动力学的影响。作者制备了不同适配体覆盖度的 AuNP-aptamer 共轭物，覆盖度从每颗粒 9.6 个到 258 个适配体，并通过 TEM、UV-Vis、荧光光谱、动态光散射（DLS）和 zeta 电位表征其粒径、分散性、表面电荷及荧光...
Fluorescence Biosensor for Real-Time Interaction Dynamics of Host Proteins with HIV-1 Capsid Tubes.
人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）衣壳是宿主蛋白和小分子结合的界面，参与病毒生活周期的多个步骤，但目前尚缺乏利用组装衣壳晶格定量测量宿主—病原体相互作用动力学的方法。本文开发了一种单分子荧光生物传感器，以自组装HIV-1衣壳蛋白（CA）管作为生物识别元件，并在微流控装置中利用全内反射荧光显微镜（TIRF）对衣壳结合物进行成像。该传感...
A DNA-Based Biosensor Assay for the Kinetic Characterization of Ion-Dependent Aptamer Folding and Protein Binding.
治疗与诊断用核酸适配体被设计为高亲和、高特异结合靶标。适配体相互作用的结构与动力学分析日益重要。本文报道一种基于 switchSENSE 的荧光适配体传感器，用于详细表征适配体–分析物相互作用及适配体折叠，以凝血酶结合适配体（TBA）为模型体系。TBA 折叠为 G-四联体及其与凝血酶的结合强烈依赖溶液中离子的种类和浓度。作者实时观察...
Assembly and Characterization of a Slingshot DNA Nanostructure for the Analysis of Bivalent and Bispecific Analytes with Biosensors.
新型治疗性抗体常具有多价或多特异性结合位点，其结合动力学受亲和力与亲合力共同影响，传统生物传感器表面随机固定抗原难以区分单臂与双臂结合。本文提出一种形似弹弓的 DNA 纳米结构，由 90 个核苷酸组成，包含 30 bp 双链刚性柄和单链弹弓臂；通过杂交 20 nt 互补间隔链，可在约 6.1 nm 的固定距离上装载两个相同或不同抗原...
FLiK: a direct-binding assay for the identification and kinetic characterization of stabilizers of inactive kinase conformations.
尽管数百种激酶抑制剂处于药物发现和临床前阶段，FDA 批准的激酶抑制剂数量仍明显偏低，反映出激酶抑制剂开发面临的挑战。以 ATP 竞争性抑制剂靶向蛋白激酶是经典策略，但 ATP 结合位点高度保守，常导致抑制剂选择性差。为解决该问题，作者开发了一种高通量筛选技术，可鉴别通过结合激酶结构域变构口袋而稳定非活性激酶构象的抑制剂。本文描述如...
Binding kinetics of biomolecule interaction at ultralow concentrations based on gold nanoparticle enhancement.
测量蛋白质-蛋白质相互作用在超低浓度下的动力学常数，对表征生物特异性亲和力以及评估临床诊断的灵敏度、效率和准确性至关重要。本研究提出一种基于局域表面等离子体耦合荧光光纤生物传感器（LSPCF-FOB）的方法，用于在夹心免疫检测中计算 pg/mL 级蛋白质-蛋白质相互作用的结合常数。该方法采用双室模型，在反应室静止条件下实现反应限制动...
Quantification of receptor targeting aptamer binding characteristics using single-molecule spectroscopy.
本文提出一种基于荧光相关光谱（FCS）的单分子实验设计，用于定量针对鼠伤寒沙门氏菌（Salmonella typhimurium）表面受体的适配体结合特性。作者利用特异性识别沙门氏菌外膜蛋白的适配体，并通过荧光标记探针，在活单细胞水平研究结合与未结合适配体的扩散动力学。通过自相关分析，可确定适配体在活细胞表面的结合动力学，并计算解离...
Quantitative measurement of binding kinetics in sandwich assay using a fluorescence detection fiber-optic biosensor.
光纤生物传感器因可用于监测生物分子相互作用而受到广泛关注。本文报道了一种基于夹心法检测抗体–抗原相互作用的荧光检测光纤生物传感器（FD–FOB）。该传感器利用无包层光纤表面产生的倏逝波选择性激发荧光标记抗体，从而在传感界面附近形成受限荧光检测区域，实现结合动力学的定量测量。对免疫球蛋白G（IgG）与抗小鼠IgG体系的测量得到结合速率...