12 条结果 关键词:蛋白质组学 ×

Bioenergetic shift and proteomic signature induced by lentiviral-transduction of GFP-based biosensors.

Redox biology 2024 Barakat S, Çimen Ş, Miri SM, Vatandaşlar E 等 10 人

荧光蛋白是生物研究中的关键工具,但其表达常伴随细胞功能紊乱、细胞毒性和免疫原性等副作用。近年研究发现,绿色荧光蛋白(GFP)荧光团成熟过程会产生过氧化氢(H2O2),GFP 表达造成的结构与功能损伤可能与此相关。本研究评估基于 GFP 的 HyPer7 生物传感器对细胞稳态和蛋白质组变化的影响,以识别氧化应激相关风险。稳定表达基因组...

New insights into the antibacterial and quorum sensing inhibition mechanism of

3 Biotech 2021 Kong J, Wang Y, Xia K, Zang N 等 6 人

本研究旨在考察艾叶提取物(AALE)对铜绿假单胞菌 PAO1 的群体感应(QS)抑制活性及其分子机制。以 C. violaceum CV026 为生物传感器,AALE 可显著抑制紫罗兰素产生而对菌体生长影响较小;较高浓度则抑制生长。亚抑菌浓度 AALE 以剂量依赖方式降低 PAO1 的 QS 调控毒力因子(绿脓菌素、弹性蛋白酶、鼠李...

In situ analysis of liposome hard and soft protein corona structure and composition in a single label-free workflow.

Nanoscale 2020 Kari OK, Ndika J, Parkkila P, Louna A 等 9 人

方法学限制制约了蛋白冠形成研究,延缓纳米药物开发及临床转化。本文建立了一种无标记工作流,用于原位测定脂质体硬冠与软冠的结构参数及相应蛋白质组成:采用表面等离子共振(SPR)和定制生物传感器,在脂质体表面原位测定结构并分离冠组分;再结合高灵敏度纳升级液相色谱串联质谱(nLC-MS/MS)和开源生物信息学平台进行蛋白质组分析。研究在动态...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 蛋白冠脂质体多参数SPR蛋白质组学

Protein profiling of metal-resistant Bacillus cereus VITSH1.

Journal of applied microbiology 2019 Matilda CS, Mannully ST, Viditha RP, Shanthi C

本研究旨在探究铬抗性枯草芽孢杆菌 VITSH1 在重金属毒性胁迫下的蛋白质组学变化及抗氧化酶活性。通过比较有无金属条件下菌体蛋白表达与抗氧化酶活性,采用 SDS-PAGE 分析铬处理条件下差异表达蛋白,并结合质谱与生物信息学工具鉴定参与金属结合、蛋白合成、蛋白折叠、能量代谢和运动性的蛋白。原位凝胶酶活染色显示,金属胁迫下抗氧化酶活性...

Gold nanoparticles and bioconjugation: a pathway for proteomic applications.

Critical reviews in biotechnology 2017 Couto C, Vitorino R, Daniel-da-Silva AL

近年来,金纳米粒子(AuNPs)因具有增强的光学、化学和电学性质而受到广泛关注,其应用已拓展至物理、化学、生物、工业和医学等领域。AuNPs 尺寸通常为 2–100 nm,具有局域表面等离子体共振(LSPR)、表面增强拉曼散射(SERS)和良好生物相容性,并能与生物分子形成稳定共轭,为蛋白质组学研究提供了新工具。本文综述了 AuNP...

Amyloid-binding proteins: affinity-based separation, proteomic identification, and optical biosensor validation.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2015 Medvedev A, Buneeva O, Kopylov A, Gnedenko O 等 7 人

淀粉样蛋白β(Aβ)被认为是阿尔茨海默病发生和进展的关键分子。尽管已有证据表明 Aβ 可在细胞内积累,但脑内细胞 Aβ 结合蛋白仍缺乏系统表征。本文描述了一种基于亲和作用的大鼠脑 Aβ 结合蛋白谱分析方案,包括其蛋白质组学鉴定和表面等离子共振(SPR)光学生物传感器验证。方案首先利用 SPR 优化 Aβ 固定条件并选择合适树脂制备亲...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 淀粉样蛋白βAβ结合蛋白亲和层析蛋白质组学

The effects of endogenous non-peptide molecule isatin and hydrogen peroxide on proteomic profiling of rat brain amyloid-β binding proteins: relevance to Alzheimer's disease?

International journal of molecular sciences 2014 Medvedev AE, Buneeva OA, Kopylov AT, Gnedenko OV 等 9 人

淀粉样蛋白β(Aβ)被认为是阿尔茨海默病(AD)发生与进展的关键分子。尽管已有证据表明Aβ可在细胞内积累,但细胞内脑淀粉样结合蛋白仍缺乏系统表征。本研究对大鼠脑匀浆进行蛋白质组学分析,鉴定出89种细胞内Aβ结合蛋白,其中约25%为先前鉴定为特异性结合内源神经保护分子异吲哚-2,3-二酮(isatin)的蛋白。超过30%的Aβ结合蛋白...

Serum, urine, and breath-related biomarkers in the diagnosis of obstructive sleep apnea in children: is it for real?

Current opinion in pulmonary medicine 2012 Gozal D

儿童睡眠实验室资源有限,导致儿童阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)诊断和治疗延迟,增加 OSA 相关并发症风险。本文综述转录组学、蛋白质组学及呼气冷凝物生物标志物发现进展,并评估其用于建立可靠、经过验证的儿童 OSA 诊断方法的可行性。基因表达芯片显示,少数基因在儿童 OSA 中发生显著且可重复的表达改变,可能具备区分 OSA 的能力。多...

Can the soil bacterium Cupriavidus necator sense ZnO nanomaterials and aqueous Zn²⁺ differentially?

Nanotoxicology 2012 Neal AL, Kabengi N, Grider A, Bertsch PM

合成金属氧化物纳米材料的毒性通常通过两种机制发挥:一是释放具有毒性的自由金属离子,二是通过表面介导的理化过程产生羟基自由基等活性氧,破坏细胞膜和细胞器。从监管角度看,在生物或自然介质中同时存在纳米颗粒时检测自由金属离子十分困难,使摄取途径和毒性机制难以判定。尽管体外研究表明氧化锌纳米颗粒对土壤细菌Cupriavidus necato...

Proteomic characterization of Jurkat T leukemic cells after dopamine stimulation: A model of circulating dopamine-sensitive cells.

Biochimie 2011 Alberio T, Anchieri C, Piacentini L, Gentile G 等 7 人

T细胞是循环中的多巴胺敏感细胞,可能在外周水平反映多巴胺能神经元中发生的生化改变。人CD4+ T白血病Jurkat细胞系已被广泛用于研究T细胞信号与凋亡。本文将其表征为循环多巴胺敏感细胞模型,并通过分析细胞蛋白质组变化评估其对多巴胺刺激的反应。结果显示,Jurkat细胞同时表达D1样和D2样多巴胺受体以及膜和囊泡转运体,但不表达D4...

Automated SPR-LC-MS/MS system for protein interaction analysis.

Journal of proteome research 2008 Hayano T, Yamauchi Y, Asano K, Tsujimura T 等 7 人

我们开发了一种新型自动化系统,通过整合表面等离子共振(SPR)生物传感器与高灵敏度纳流液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)来分析蛋白复合物。在哺乳动物细胞中表达同时带有 His 标签、FLAG 标签和生物素化序列的诱饵蛋白;利用 His 标签从细胞裂解液中初步纯化后,将样品蛋白混合物施加到 SPR 生物传感器上,使蛋白复合物捕获在...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 SPR-LC-MS/MS蛋白相互作用蛋白质组学亲和纯化

Proteomics characterization of the cytotoxicity mechanism of ganoderic acid D and computer-automated estimation of the possible drug target network.

Molecular & cellular proteomics : MCP 2008 Yue QX, Cao ZW, Guan SH, Liu XH 等 10 人

灵芝(Ganoderma lucidum)三萜类成分可抑制多种癌细胞生长,被认为是其抗肿瘤作用的基础。灵芝酸D(ganoderic acid D, GAD)是灵芝三萜主要成分之一。本文以 HeLa 人宫颈癌细胞为模型,发现 GAD 处理 48 h 后以剂量和时间依赖方式抑制细胞增殖,IC50 为 17.3±0.3 μM;流式细胞术和...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 灵芝酸D14-3-3蛋白药物靶点蛋白质组学