Analytical biochemistry
2016
Zou Q, Yang KL
为对抗β-内酰胺酶介导的抗生素耐药,需要鉴定新型抑制剂。本研究利用噬菌体展示库从随机12肽库中筛选出三个结合青霉素酶的肽:P1(DHIHRSYRGEFD)、P2(NIYTTPWGSNWS)和P3(SHSLPASADLRR)。采用表面等离子共振(SPR)对筛选肽与青霉素酶的结合特异性进行定量比较。以P3-GGGC(SHSLPASADL...
Analytical and bioanalytical chemistry
2016
Peltomaa R, López-Perolio I, Benito-Peña E, Barderas R 等 5 人
噬菌体(bacteriophage,简称phage)基生物检测是传统抗体免疫检测的有前景替代方案。噬菌体易于化学偶联或基因工程改造,结构稳健、自然界分布广泛且对人无害;其生产通常无需动物接种与致敏,流程简单且成本低。近年来,噬菌体生物传感器因兼具稳健性、灵敏度、选择性以及易于集成到多种换能器件而受到关注。本综述系统回顾近年来噬菌体生...
Nano letters
2015
Jin HE, Zueger C, Chung WJ, Wong W 等 6 人
本文报道了一种高选择性、高灵敏度的生物传感器,用于检测环境毒性分子十溴二苯醚(DBDE)。DBDE 是多溴二苯醚(PBDE)类阻燃剂中最常见的同系物之一。作者通过噬菌体展示文库高通量筛选,发现了一种特异性结合 DBDE 的肽受体。该结合肽具有由两个 Trp-His/Asn-Trp 重复单元构成的共识结合口袋,能够以多价方式结合 DB...
Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry
2015
Lee HY, Choi JS, Guruprasath P, Lee BH 等 5 人
本研究开发了一种基于肌红蛋白特异性结合肽的简单、高灵敏电化学生物传感器,用于急性心肌梗死早期诊断。通过噬菌体展示筛选得到 Myo-3R7 肽(CPSTLGASC,838 Da),其可特异性结合肌红蛋白。该肽通过双硫代双(琥珀酰亚胺基丙酸酯)(DSP)自组装单层共价固定于金电极表面,并用荧光微阵列扫描和循环伏安法确认固定。以 Fe(C...
Archivum immunologiae et therapiae experimentalis
2015
Hodyra K, Dąbrowska K
分子工程的进展推动了医学发展,但新一代抗癌药物、替代性生物传感器和疫苗等仍是分子生物学与生物技术面临的难题。噬菌体作为一种可工程化的生物技术工具,为传统方法提供了有前景的替代方案。噬菌体可用作抗癌制剂、疫苗设计的新平台,或药物发现中的靶向载体;同时也可用于现代细胞成像、生物传感器构建以及食品病原体检测。本文综述了噬菌体分子与化学工程...
Journal of translational medicine
2014
Zhu M, Gong X, Hu Y, Ou W 等 5 人
甲型H5N1流感病毒可感染人类并导致死亡,暴发前及时诊断对公共卫生至关重要。现有临床生化诊断方法仍存在不足,市售H5N1诊断试剂盒多依赖传统单克隆抗体,难以满足临床应用需求。纳米抗体(Nanobody/VHH)具有分子量小、特异性高、稳定性好和易于大量表达等优点,是诊断与治疗的潜在工具。本研究通过噬菌体展示技术从VHH文库中筛选获得...
Journal of applied microbiology
2014
Shahi B, Mousavi Gargari SL, Rasooli I, Rajabi Bazl M 等 5 人
本研究旨在通过易错PCR构建针对肉毒神经毒素E(BoNT/E)的重组单可变域(VHH)二级噬菌体展示突变库。作者以免疫骆驼来源、可结合BoNT/E重链结合域的特异性VHH基因为模板,采用易错PCR引入随机点突变,并将突变片段克隆至pComb3x噬菌粒载体,构建二级噬菌体展示库。随后通过多轮生物筛选,从展示BoNT/E Hc纳米抗体的...
Comptes rendus biologies
2014
Sabir JS, Atef A, El-Domyati FM, Edris S 等 7 人
骆驼科动物具有独特的重链抗体(HCAbs,VHH),商品名为纳米抗体(Nb),仅由重链同源二聚体组成。由于基于免疫骆驼的文库构建耗时、昂贵,且对某些抗原可能冗余,作者以非免疫骆驼血清为来源构建骆驼科 VHH 非免疫文库,获得具有亚纳摩尔亲和力、适合常规免疫应用的结合子代。该方法快速,可恢复更多样、非特异且不含特定抗体亚群的 VHH ...
Analytical chemistry
2013
Knez K, Noppe W, Geukens N, Janssen KP 等 13 人
生物传感器对灵敏度和特异性的不断提高,使多价生物受体成为研究热点。在噬菌体亲和肽领域,整个噬菌体颗粒可被用作受体,而非仅使用单个展示肽。然而,完整噬菌体颗粒的结合动力学尚未得到系统研究,而这对于设计高效应用至关重要。本文利用自研光纤表面等离子共振(FO-SPR)生物传感器,研究展示肽库的噬菌体对增强绿色荧光蛋白(eGFP)的亲和力与...
Analytical chemistry
2013
Ding X, Yang KL
本文报道了一种基于寡肽识别元件的表面等离子共振(SPR)生物传感器,用于在线检测草甘膦。传感元件表面修饰了通过噬菌体展示库筛选获得的寡肽 TPFDLRPSSDTR。该寡肽对草甘膦具有较高结合特异性,平衡解离常数 KD 为 8.6 μM,可能与其序列中精氨酸(R)和天冬氨酸(D)残基的氢键及静电作用有关。为检测缓冲液中的草甘膦,将寡肽...
Angewandte Chemie (International ed. in English)
2013
Palaniappan KK, Ramirez RM, Bajaj VS, Wemmer DE 等 6 人
磁共振成像在分子成像中受限于对非水分子的低灵敏度。氙化学惰性、低毒、可溶于水与组织,且超极化129Xe可将信号增强逾10000倍,因此可作为分子成像传感介质。本文报道一种基于丝状噬菌体的多价129Xe NMR生物传感器。该传感器以fd噬菌体为载体,其小衣壳蛋白p3展示靶向表皮生长因子受体(EGFR)或肉毒毒素A(BONT)的单链抗体...
Methods (San Diego, Calif.)
2012
Tornetta M, Reddy R, Wheeler JC
过去二十年间,M13噬菌体展示用于抗体发现与优化已显著发展。抗体展示与筛选方法包括直接展示于pIII,或通过二硫键及卷曲螺旋适配蛋白间接展示。本文描述将Fab库展示于病毒颗粒另一端较小的pIX蛋白,并将其应用于从天然库中发现新型抗体。基于pIX介导展示的抗体筛选结果与其他体外方法相当,并可通过抗原结合噬菌体直接感染大肠杆菌高效回收,...
Journal of biotechnology
2012
Hien TB, Maeng JH, Lee BH, Seong GH 等 6 人
本研究以人免疫球蛋白G(hIgG)为目标抗原,通过噬菌体展示技术筛选能够模拟抗hIgG抗体结合能力的12-mer肽。实验采用常规与改良两种生物筛选(biopanning)方案,共进行5轮筛选;每轮包括将噬菌体展示12-mer肽库与hIgG包被磁珠孵育、洗涤未结合噬菌体、洗脱结合噬菌体,洗脱物可选择扩增富集或不经扩增直接进入下一轮。经...
Bioorganic & medicinal chemistry
2012
Miyano Y, Tsukuda S, Sakimoto I, Takeuchi R 等 21 人
全氟辛烷磺酸(PFOS)是环境中广泛分布且具有动物毒性的持久性污染物,但其生理作用机制尚不清楚。本研究在聚乙二醇-聚丙烯酰胺共聚物(PEGA)树脂表面通过固相合成构建了 PFOS 类似物,并利用 T7 噬菌体展示技术筛选优先结合该 PFOS 类似物的随机肽库。经多轮生物筛选后,对洗脱噬菌体展示肽进行测序,并采用 RELIC 生物信息...
Biosensors & bioelectronics
2012
Ding X, Zhang W, Cheng D, He J 等 5 人
本研究利用噬菌体展示文库筛选出两条对噻虫胺和吡虫啉等新烟碱类农药具有高度特异结合能力的寡肽序列 RKRIRRMMPRPS(P1)和 RNRHTHLRTRPR(P2)。P1 对噻虫胺具有较高亲和力,P2 对吡虫啉具有较高亲和力;尽管两种农药分子结构相似,二者交叉结合极低。为构建新烟碱类农药生物传感器,作者合成了上述寡肽,并将其固定于裸...
Analytical and bioanalytical chemistry
2012
Pavan S, Berti F
本综述讨论短肽(不超过50个氨基酸)作为仿生活性识别元件在传感系统中的应用。近年来,基于不同策略发展了多种肽基传感器:根据单个或少数氨基酸与靶标之间的已知相互作用设计合成肽,并关注能促使传感肽在传感器表面分子间自组装的肽基序;由此可获得高灵敏度、结构复杂的传感器,但设计肽受限于计算机辅助设计的严重困难。随机噬菌体展示短肽从大型、非聚...
PloS one
2011
Wu J, Park JP, Dooley K, Cropek DM 等 6 人
本文提出一种快速开发蛋白生物传感器的平台:利用 M13 噬菌体展示筛选能结合目标蛋白的短无序肽,化学合成后固定于金表面,采用电化学阻抗谱(EIS)检测目标;石英晶体微天平(QCM)用于开发过程中的诊断。作者以肝毒性标志物丙氨酸氨基转移酶(ALT)为例,经生物筛选获得新肽 ALT5-8(WHWRNPDFWYLK),表达该肽的噬菌体对固...
Molecular immunology
2011
Goodchild SA, Dooley H, Schoepp RJ, Flajnik M 等 5 人
埃博拉病毒属可引起人和非人灵长类暴发,病死率最高可达90%。为在临床和环境样品中快速、灵敏、特异地检测这些病原体,需要稳健的免疫检测试剂。本研究以扎伊尔埃博拉病毒免疫小鼠和护士鲨,分别构建小鼠单链抗体(scFv)和鲨源新抗原受体可变区(IgNAR V)重组抗体库,并通过噬菌体展示生物筛选获得候选抗体。这是首次报道护士鲨针对颗粒性抗原...
Analytical chemistry
2011
Zhu X, Kriegel AM, Boustany CA, Blake DA
本研究为环境铀的抗体传感器特异性构建并筛选了重组单链可变片段抗体(scFv)。以UO2^2+与2,9-二羧基-1,10-菲啰啉(DCP)形成的螯合物偶联钥孔海鞘血蓝蛋白(KLH)免疫兔,从脾细胞提取RNA,扩增免疫球蛋白重链和轻链可变区基因,克隆至噬菌体pSD3载体,构建重组抗体库并进行噬菌体展示。通过五轮逐步加严的竞争性生物筛选,...
Bioconjugate chemistry
2011
Cha MY, Lee HY, Ko Y, Shim H 等 5 人
本研究基于药效团导向策略,利用单链可变片段(scFv)作为识别元件,开发了可广谱或选择性检测氟喹诺酮类抗生素的荧光生物传感器。作者通过对氟喹诺酮抗生素药效团进行结构修饰,设计合成生物素化抗生素类似物,并采用噬菌体展示技术从 scFv 文库中筛选获得相应识别模块。所得 A2 和 F9 scFv 与其代表性抗原的结合亲和力为微摩尔级(表...