Frontiers in bioengineering and biotechnology
2018
Frazão CR, Maton V, François JM, Walther T
本文报道了一种基于荧光的代谢物传感器,用于在大肠杆菌内检测多种具有生物技术价值的醛类。YqhC 是一种转录调控因子,在醛类存在时可上调 yqhD-dkgA 操纵子。作者利用该特性构建了双模块生物传感器:感知模块组成性表达 yqhC,报告模块则在 yqhD 启动子控制下表达 syfp2 荧光报告基因。通过对感知模块和报告模块的 5'-...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2018
Cohen MS, Stewart ML, Goodman RH, Cambronne XA
游离烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)是NAD+消耗酶的底物,其局部浓度可影响PARP/ARTD和sirtuin等酶活性。本章介绍利用基因编码荧光生物传感器测量亚细胞区室NAD+浓度的方法,并讨论该传感器的局限性与潜在应用。内容包括:(1)基于磁珠的方法校准仪器与实验装置;(2)在细胞中设置必要对照并正确进行比率荧光测量;(3)采用适...
Applied microbiology and biotechnology
2018
Takeya T, Yurimoto H, Sakai Y
本研究对甲基营养酵母毕赤酵母(Pichia pastoris)进行单细胞分析,开发了一种用于检测异源酶产生甲醇的生物传感器。该传感器中,甲醇及其后续代谢产物可诱导位于甲醇诱导型启动子控制下的荧光蛋白基因表达。通过荧光显微图像定量分析,作者筛选了甲醇诱导型启动子与宿主菌株,并优化预培养和检测条件,以提高甲醇检出限。流式细胞分选(FAC...
Cell chemical biology
2018
Birnbaum MD, Nemzow L, Kumar A, Gong F 等 5 人
突变报告系统是量化基因组稳定性的重要工具,但现有方法多依赖细胞存活或死亡来区分突变细胞,通常需要数天至数周,且受细胞类型和细胞毒性试剂限制,难以评估急性或时间依赖的突变变化。作者基于 mCherryFP 荧光依赖 Trp98 残基的发现,将该位点密码子 TGG 替换为终止密码子 TGA,构建突变激活型荧光生物传感器 CherryOF...
PLoS neglected tropical diseases
2018
Voyton CM, Qiu Y, Morris MT, Ackroyd PC 等 8 人
布氏锥虫血液型生活阶段完全依赖葡萄糖代谢产生 ATP,该过程发生在类过氧化物酶体细胞器糖体中。许多研究关注葡萄糖摄取与代谢,但此前无法监测活寄生虫细胞和细胞器葡萄糖浓度变化。作者开发了一种非破坏性技术,利用荧光蛋白生物传感器 FLII12Pglu-700μδ6 结合流式细胞术,监测布氏锥虫细胞质和糖体葡萄糖水平。携带该传感器的寄生虫...
ACS infectious diseases
2018
Voyton CM, Morris MT, Ackroyd PC, Morris JC 等 5 人
布氏锥虫引起人类非洲锥虫病,在哺乳动物宿主体内依赖葡萄糖代谢产生ATP。靶向葡萄糖摄取或调控是潜在治疗策略,但现有方法难以鉴定葡萄糖摄取与调控抑制剂。本文建立了一种基于FRET流式细胞术的高通量筛选方法,用于鉴定降低锥虫细胞质和糖体葡萄糖水平的小分子干扰物。作者将基因编码的荧光蛋白葡萄糖传感器FlII12PGlu-600µ分别表达于...
Nature communications
2018
Wood RJ, Ormsby AR, Radwan M, Cox D 等 11 人
维持蛋白质折叠稳态(proteostasis)的质量控制(QC)蛋白池具有动态性,但在人类疾病中可能耗竭。定量界定该 QC 池的深度是一个挑战。作者开发了一种新的生物传感器,并结合流式细胞术方法和数学建模,测量 QC 系统作为 holdase 结合未折叠底物以及抑制生物传感器聚集的能力。该生物传感器由一系列具有不同折叠稳定性的 ba...
FEMS yeast research
2018
Osiro KO, Brink DP, Borgström C, Wasserstrom L 等 6 人
建立工业上具有竞争力的木质纤维素发酵过程的关键挑战之一,是利用酿酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 实现高效混合糖发酵。尽管代谢工程策略已成功,重组酵母对木糖的同化速率仍显著低于首选碳源葡萄糖。此前我们建立了体内生物传感器菌株 TMB371X,将主要糖信号通路中的不同启动子(HXT1/2/4p、SUC2p、CA...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2018
Ambri F, Snoek T, Skjoedt ML, Jensen MK 等 5 人
在细胞工厂开发中,筛选步骤常依赖低通量分析方法,落后于多样性构建方法,使最优细胞工厂设计的鉴定与选择耗时且昂贵,制约制造过程。在酿酒酵母中,将原核生物别构调控转录因子作为代谢物生物传感器,是缓解该筛选瓶颈的有效策略。本文提供在酿酒酵母中筛选并整合原核转录激活因子作为代谢物生物传感器的方案。以 LysR 型转录调控因子(LTTR)家族...