6 条结果 关键词:片段筛选 ×

Identification of fragments targeting SMYD3 using highly sensitive kinetic and multiplexed biosensor-based screening.

RSC medicinal chemistry 2024 FitzGerald EA, Cederfelt D, Lund BA, Myers NEM 等 7 人

本研究利用光栅耦合干涉(GCI)生物传感器,采用新型多路复用实验设计,对含1056个片段的小分子库进行筛选,以鉴定靶向SMYD3的新配体。SMYD3是抗癌药物潜在靶点,早期研究主要关注其赖氨酸甲基转移酶活性抑制剂,但SMYD3具有多个蛋白互作伙伴并在致癌中可能发挥多种作用,因此靶向该蛋白的配体作用方式尚不明确。作者旨在区分结合活性位...

Fragment screening using biolayer interferometry reveals ligands targeting the SHP-motif binding site of the AAA+ ATPase p97.

Communications chemistry 2022 Bothe S, Hänzelmann P, Böhler S, Kehrein J 等 10 人

生物传感器技术在基于片段的药物发现中日益重要。AAA+ ATP酶p97是维持蛋白稳态的关键蛋白,也是癌症化疗潜在靶点。现有p97抑制剂主要抑制其ATP酶活性,会全局干扰p97介导的多种过程;若通过蛋白-蛋白相互作用抑制剂阻断辅因子与N结构域结合,则可选择性调控特定功能。本文建立基于生物层干涉(BLI)的片段筛选方法,以p97 N结构...

Discovery of fragments inducing conformational effects in dynamic proteins using a second-harmonic generation biosensor.

RSC advances 2021 FitzGerald EA, Butko MT, Boronat P, Cederfelt D 等 11 人

蛋白质功能常依赖配体诱导的构象变化,但常规生物物理筛选通常不能直接揭示配体如何影响其功能。本文开发了一种高通量第二谐波产生(SHG)生物传感器,用于实时检测与蛋白结合后诱导构象变化的片段并识别动态区域。作者以乙酰胆碱结合蛋白(AChBP)为模型,建立野生型和六个单半胱氨酸突变体的多孔板SHG检测体系,并通过胺基或马来酰亚胺化学偶联第...

Identification of

Molecules (Basel, Switzerland) 2019 Prakash O, Führing J, Post J, Shepherd SM 等 8 人

利什曼病是由利什曼原虫引起的被忽视热带病,现有治疗药物有限且无疫苗。UDP-葡萄糖(UDP-Glc)和 UDP-半乳糖(UDP-Gal)的生物合成对原虫存活至关重要,受 UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(UGP)和 UDP-糖焦磷酸化酶(USP)控制。本研究以 L. major USP 为靶标,采用生物层干涉(BLI)技术筛选 965 个小...

Development of a plate-based optical biosensor fragment screening methodology to identify phosphodiesterase 10A inhibitors.

Journal of medicinal chemistry 2013 Geschwindner S, Dekker N, Horsefield R, Tigerström A 等 7 人

本文报道一种用于片段筛选的新型板载光学生物传感器方法,可在384孔板中运行。该方法基于溶液抑制实验(ISA),将专门设计的靶标定义化合物(TDC)共价固定于传感器表面;TDC依据磷酸二酯酶10A(PDE10A)的晶体结构信息设计,使其保留与靶标蛋白结合的能力。重组PDE10A催化域与固定TDC结合后,传感器表面质量增加,导致反射光特...

Biosensor-based small molecule fragment screening with biolayer interferometry.

Journal of computer-aided molecular design 2011 Wartchow CA, Podlaski F, Li S, Rowan K 等 7 人

基于生物传感器的小分子片段筛选是药物发现中的有价值工具。与许多生化方法相比,该方法可通过检查结合谱和响应,将主要命中与非特异性或非理想相互作用区分开,从而降低假阳性率。生物层干涉(BLI)通过测量可见光从光学层和含感兴趣蛋白的生物层反射所产生的干涉图案变化来监测小分子相互作用,是一种较新的方法。BLI 采用浸入 96 孔或 384 ...