本研究首次从刺山柑（Capparis sicula subsp. sicula）果实中制备甲醇-氯仿提取物、热解液和绿色合成银纳米颗粒（AgNPs），并系统比较其化学组成与生物活性。GC–MS/MS分析显示提取物和热解液主要含亚油酸甲酯、棕榈酸甲酯和油酸甲酯；LC–ESI–MS/MS显示提取物中橙皮苷含量最高（7.534 mg/g）...
非营养甜味剂（NNS）作为糖替代品可降低热量摄入，但其对肠道微生物组的长期影响仍有争议。本研究以群体感应（QS）生物传感器模型菌紫色杆菌 ATCC 12472 和铜绿假单胞菌 PAO1 为对象，考察塔格糖、阿洛酮糖、瑞鲍迪苷 A（Reb-A）和糖精对 QS 调控表型及基因表达的影响。结果显示，不同 NNS 作用存在差异：塔格糖和阿洛...
在后抗生素时代，抗毒力治疗难以直接替代现有抗菌方案，药物再利用成为重要替代策略。针对多重耐药铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）造成的临床负担，本研究评估常用药物 fexofenadine（FeX）、ivermectin（IvM）、nitrofurantoin（NiT）、levocetrizine（LvC）、...
本文旨在通过计算筛选低成本肽受体，用于环境中新污染物农药的灵敏检测。作者以蛋白数据银行中 Lymnaea stagnalis 乙酰胆碱结合蛋白 Q55R 突变体与吡虫啉复合物（PDB: 3WTH）为起点，利用 PLIP 分析农药与 A、B、C 链相互作用区，选取三条短肽 YSP09、DRM12 和 WQW13。分子对接显示三者可与吡...
海洋蓝藻在藻华期间可产生结构多样的生物活性次级代谢物，这些化感物质赋予微藻对抗竞争微生物和草食动物的化学防御能力。本研究从一株海洋蓝藻 cf. Lyngbya sp. 中分离并纯化得到少量含环丙烷的新化合物 benderadiene（2）以及已知脂质酸 lyngbyoic acid（1），并通过光谱方法完成结构表征。利用基于铜绿假单...
过去十年，人们对具有抗菌和抗氧化作用的天然植物精油兴趣显著增加。耐药菌持续存活依赖群体感应（QS）信号网络，因此需要替代抗菌化合物。本研究分析广藿香精油（PEO）的植物化学成分并评估其抗氧化活性。DPPH 自由基清除法显示 PEO 具有有效抗氧化活性（IC50 19.53 mg/mL）。采用生物传感菌株 Chromobacteriu...
生物传感器是广泛应用于医疗诊断、食品质量控制和环境监测的分析工具，其设计需要兼顾成本、效率与功能提升。实验方法在生物传感器开发中已取得重要进展，但酶、蛋白质、肽、抗体和适配体等识别元件仍存在稳定性、寿命、制备成本、样品基质干扰及温度/pH敏感性等不足。计算设计被提出为弥补实验局限的关键途径，需要可靠的生物传感器各段结构预测、稳定性分...
羟基酪醇经生物酶催化形成的低聚物在抗氧化、抗炎和抗癌变等方面具有优于单体的多效健康改善作用，但其聚合工艺参数与深入机制仍不清楚。为探究羟基酪醇聚合过程，本研究考察了溶剂类型、反应液pH、反应温度和时间对聚合收率的影响，并采用分子对接揭示漆酶、酪氨酸酶和辣根过氧化物酶的结构变化。结果显示，漆酶催化羟基酪醇聚合在pH 5.0水缓冲液、5...
农药在农业中广泛使用，食品中的农药残留必须监测以防止毒性。牛乳中含量最高的蛋白质β-乳球蛋白（BLG）在其中央结合口袋（calyx）中对多种疏水配体具有较高亲和力，而许多常用农药具有疏水性。为预测BLG是否可能成为农药的非预期载体，作者对555种农药及其异构体共889个化合物进行了刚性分子对接筛选，并重点分析60个属于世界卫生组织五...
本文报道了氧化石墨烯与葡萄糖氧化酶（GOx）的分子对接研究，用于潜在葡萄糖生物传感应用。氧化石墨烯的大比表面积和良好电学性质使其成为生物传感系统中酶固定化载体和换能器的最佳候选之一。分子对接结果表明，氧化石墨烯在葡萄糖生物传感器系统中可作为GOx酶固定化载体，因为它能与GOx在远离葡萄糖活性位点的特定区域自发结合，不干扰或阻断酶辅助...
来自海洋贻贝 Crenomytilus grayanus 的 GalNAc/Gal 特异性凝集素 CGL 具有抗癌活性，代表具有 β-三叶草折叠的新型凝集素家族。此前，CGL 与 Gb3、半乳糖和半乳糖胺复合物的晶体结构及突变研究揭示其含有三个糖结合位点。CGL 能识别乳腺癌细胞表面的 Gb3 并结合常与肿瘤转化相关的黏蛋白型糖蛋白...
本文关注蜜蜂气味结合蛋白（OBP）在生物传感器开发中的应用潜力。作者采用分子建模、分子对接和系统发育分析，预测了19种非法药物与爆炸物化合物同43种蜜蜂OBP的结合情况，并讨论通过训练蜜蜂识别相关化合物的可行性。结果显示，若干复合物具有较高对接得分，如OBP16-N-苯基-2-萘胺（-12.25 kcal/mol）、3BJH-快克可...
设计快速、简便、选择性高且低成本的生物传感器技术，是检测各类农药的重要方向。本文通过分子对接、特异性倾向分析和蛋白质识别能力评估，探讨农药检测的酶生物传感结构基础。研究选取乙酰胆碱酯酶（ACH）、细胞色素P450（CYP）、谷胱甘肽S-转移酶（GST）和蛋白激酶C（PKC）四种候选生物识别蛋白，分别对应神经递质、代谢、解毒和蛋白磷酸...
铜绿假单胞菌的群体感应（QS）系统通过自诱导物调控毒力因子和致病性，是抗感染干预的重要靶点。本研究考察了手性吡哆醛乳酸腙（pyridoxal lactohydrazone，PLH）在亚抑菌浓度下对铜绿假单胞菌PAO1 QS相关毒力因子的影响。PLH由手性乳酸酰肼与吡哆醛反应制得。在1/4和1/16 MIC（32和8 µg/mL）处理...
群体感应（QS）是细菌依赖种群密度的细胞间通讯过程，用于调节表型特征。决定细菌致病性和食品腐败的关键毒力因子受 QS 机制调控，因此干扰 QS 信号通路可能是控制食源性病原菌的有吸引力策略。本研究利用生物传感菌株评估天然花青素 cyanidin 对机会致病菌肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）的 QS 抑制活性...
本文提出合成并表征石墨烯，用于固定化β-半乳糖苷酶以提高半乳寡糖（GOS）产量。透射电镜显示所合成石墨烯尺寸约为25 nm，傅里叶变换红外光谱用于观察酶与纳米载体之间的相互作用。采用分子对接程序Dock v.6.5进行对接，并利用Chimera v.1.6.2和PyMOL v.1.3对蛋白—配体复合物进行可视化分析。固定化β-半乳糖...
适配体是具有稳定空间结构、可高亲和力和特异性结合靶标的短单链 DNA 或 RNA 寡核苷酸，通常通过 SELEX 实验筛选。本文提出一种用于蛋白靶标的计算机辅助适配体设计方法，包括三步：首先通过分子对接和结构分析寻找潜在结合位点；其次分别设计负责靶标识别的短序列和维持识别区构象的结构部分；最后通过分子动力学模拟和 MM–PBSA/N...
为开发基于亲和力的生物传感器平台，需要具有可用于表面固定的功能手柄的合适配体。为此，作者设计并合成了一组含不同叠氮连接臂的木瓜蛋白酶抑制剂，用于后续通过无铜应变促进叠氮–炔烃环加成（SPAAC）点击化学固定到传感器表面。同时开展分子对接研究，以判断叠氮手柄在哪些位置可被容忍而不影响配体与木瓜蛋白酶的结合亲和力。结果表明，尽管叠氮基团...
杂环二胍类化合物是强效DNA小沟结合剂，并具有良好抗寄生虫活性。为拓展此类化合物的生物活性，作者合成了一系列芳基咪酰胺（arylimidamides, AIAs）类似物；与二胍类相比，AIAs在利什曼原虫和克氏锥虫中的摄取更好。研究采用热变性（Tm）、荧光置换滴定、圆二色（CD）、DNase I足迹、生物传感器表面等离子共振（SPR...
本文报道了一种受乙酰胆碱酯酶（AChE）活性位点启发的新型六肽的设计、合成与表征，并研究其与有机磷农药敌敌畏（dichlorvos）的相互作用。研究采用分子建模、固相肽合成、高效液相色谱、紫外-可见光谱和电喷雾质谱等方法。六肽序列为 NH3+-Glu-His-Gly-Gly-Pro-Ser-COO-，其氨基酸排布模拟 AChE 催化...