高迁移率族（HMG）蛋白是内在无序的核非组蛋白染色质蛋白，通过调控真核细胞中众多基因表达参与多种生物学过程。HMGA蛋白含三个AT-hook基序，优先结合B型DNA小沟中的AT富集序列。理解AT-hook与DNA的相互作用对癌症和寄生虫病相关医学研究具有重要意义。本文报道了HMGA AT-hook 1域与AT富集DNA小沟复合物的首...
本文报道了受 Neidle 实验室启发的 DNA 小沟结合药物设计研究。作者制备并系统考察了多种双胍衍生物与 5′-GAATTC-3′ 结合位点的相互作用，采用生物传感器-表面等离子共振（SPR）和 X 射线晶体学等方法。苯并咪唑-噻吩模块是优良的小沟识别单元，苯并咪唑-噻吩-苯芳香体系中的中心噻吩可提供匹配 DNA 小沟形状的最佳...
为深入理解β-丙氨酸（β）取代及杂环数目对DNA结合亲和力与选择性的影响，作者研究了八环发夹聚酰胺（PA）及其两个β衍生物和一个六环类似物与同源DNA序列5′-TGGCTT-3′的相互作用，并利用同源DNA和五个突变DNA评估结合选择性与β效应。研究采用互补的能量与结构方法，包括紫外热熔融、生物传感器表面等离子共振（SPR）、等温滴...
随着基因组序列信息增加，利用可进入细胞的合成小分子调控基因表达成为可能，但能选择性识别不同 AT 序列的小分子仍有限。多数 DNA 小沟结合剂偏好 AATT 等 A-tract 序列，却难以区分不同 AT 序列。本文围绕 DB293 及其衍生物，研究杂环双胍阳离子在 TTAA 位点诱导二聚体结合的结构基础、结合亲和力与序列特异性。作...
鉴于双胍类化合物作为靶向 DNA 的治疗药物和生物技术试剂日益重要，有必要明确结构相近化合物与不同 AT 序列结合位点相互作用的热力学差异。本研究采用生物传感器-表面等离子共振（SPR）、等温滴定量热（ITC）、圆二色（CD）、热熔融（Tm）和分子建模等方法，系统表征了与 DB75（胍基-苯基-呋喃-苯基-胍基）相关的二价双胍化合物...