Current biology : CB
2013
Ems-McClung SC, Hainline SG, Devare J, Zong H 等 8 人
正确纺锤体组装和染色体分离依赖精确的微管动态,部分由kinesin-13 MCAK调控。Aurora B依赖磷酸化可抑制MCAK的微管去聚合活性,但机制不明。本文开发了首个用于MCAK的FRET生物传感器,显示溶液中MCAK通过C端结构域(CT)与neck相互作用而处于闭合构象。荧光寿命成像(FLIM)表明,结合微管末端的MCAK相...
The Journal of cell biology
2013
Espenel C, Acharya BR, Kreitzer G
本论文报道了一种用于在单细胞内直接监测驱动蛋白-2家族马达KIF17活性的FRET生物传感器。KIF17通过调节微管动态和组织促进上皮分化,但其活性如何受时空调控尚不清楚。多种驱动蛋白包括KIF17可采取紧凑和伸展构象,分别对应自抑制和活性状态。作者构建了全长KIF17两端分别融合mCherry和Emerald GFP的表达载体,利...
Molecular cell
2013
Aoki K, Kumagai Y, Sakurai A, Komatsu N 等 7 人
细胞外调节激酶ERK在细胞生长信号级联中起核心作用。本文利用基于荧光共振能量转移(FRET)的ERK生物传感器EKAREV,在活细胞中长时间监测ERK活性,发现ERK活性以随机脉冲形式自发出现,并可在邻近细胞间传播。在正常大鼠肾上皮细胞NRK-52E中,ERK脉冲频率随细胞密度呈钟形变化,在中等密度时最高,而脉冲幅度基本不变;脉冲频...
Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
2013
Kamioka Y, Sumiyama K, Mizuno R, Matsuda M
近年来,荧光成像因荧光蛋白和荧光染料日益丰富而受到特别关注,并推动了新型生物传感器的发展。基于 Förster 共振能量转移(FRET)原理的基因编码生物传感器已广泛用于生物学中,以可视化信号分子的时空动态。尽管此类生物传感器数量不断增加,但由于 FRET 生物传感器稳定表达困难,其应用大多局限于瞬时表达生物传感器的培养细胞。本研究...
Biochemical Society transactions
2013
Constantinou A, Polizzi KM
生物过程监测用于跟踪细胞培养进程并保证产品质量。现有代谢监测主要依赖对细胞外培养基样品进行离线测量,存在时间延迟且易引入人为误差。在合成生物学时代,可以设计和实施由生物大分子组成、能够报告细胞内环境的生物传感器。荧光报告信号可实现对培养过程的无创、非破坏性在线监测,缩短测量与干预之间的延迟。本迷你综述聚焦以 Förster 共振能量...
PloS one
2013
Marley A, Choy RW, von Zastrow M
许多G蛋白偶联受体(GPCR)定位于初级纤毛,但纤毛对GPCR信号的功能意义仍不清楚。本研究聚焦D1多巴胺受体(D1R)和β2肾上腺素受体(B2AR),二者均通过升高环磷酸腺苷(cAMP)传递信号,但纤毛定位不同。D1R在IMCD3细胞纤毛上富集,破坏纤毛并不影响其表面表达或浓度依赖性cAMP反应。作者开发了可分辨纤毛内与纤毛外cA...
Methods in cell biology
2013
Spiering D, Bravo-Cordero JJ, Moshfegh Y, Miskolci V 等 5 人
基于 Förster 共振能量转移(FRET)的生物传感器可用于在活细胞中以亚细胞分辨率和秒级时间尺度解析蛋白激活事件的动态过程,这些过程难以用传统生化和细胞生物学方法直接观察。本文系统介绍将 FRET 生物传感器原始图像数据转化为相对比率定量测量的基本图像处理流程,重点讨论遗传编码单链 FRET 传感器以及分子间双链设计系统的处理...
Applied microbiology and biotechnology
2013
Zhang C, Wei ZH, Ye BC
2-氧代戊二酸(2OG)是高度保守的三羧酸循环代谢物,不仅在代谢中起关键作用,还在多种生物中作为信号分子。环境无机氮被微生物还原为铵,其代谢途径涉及2OG向谷氨酸和谷氨酰胺的转化。实时追踪2OG有助于细胞代谢与信号转导研究。本文基于荧光共振能量转移(FRET)构建了一种遗传编码的2OG生物传感器,将NifA蛋白中功能性的2OG结合域...
Journal of biotechnology
2013
Tanimura A, Mochizuki T, Morita T, Nezu A 等 7 人
肌醇1,4,5-三磷酸(IP3)受体包括IP3R1、IP3R2和IP3R3三个亚型。尽管已合成多种IP3受体配体,但尚无已知亚型选择性配体。作者利用基于荧光共振能量转移(FRET)的IP3生物传感器LIBRAvI、LIBRAvII和LIBRAvIII,建立了一种简单荧光方法,用于检测IP3受体配体的亚型选择性。向表达相应生物传感器的...
Biochimica et biophysica acta
2013
Bretón-Romero R, Kalwa H, Lamas S, Michel T
ADP在血管内皮中发挥关键信号作用,ADP受体是多种心血管药物靶点,但其细胞内调控通路尚未完全阐明。本研究鉴定了磷酸酶PTEN在ADP依赖性内皮型一氧化氮合酶(eNOS)激活以及内皮细胞脂质和蛋白激酶通路中的重要作用。我们发现,siRNA介导的PTEN敲低可增强ADP促进的eNOS激活和p38 MAPK磷酸化;然而,siRNA敲低p...
PloS one
2013
Zacharia J, Mauban JR, Raina H, Fisher SA 等 5 人
背景与目的:活体中确定血管受体作用困难,难以通过全身拮抗或基因操作实现。本研究用活体荧光显微镜测量交感受体,尤其α1-肾上腺素能受体亚型,对小鼠股动脉收缩激活的贡献。方法:在表达MLCK钙-钙调蛋白生物传感器的小鼠中,活体荧光显微镜测定股动脉直径和细胞内钙([Ca2+]i),并局部应用药理学试剂判断血管受体对张力性收缩和[Ca2+]...
Cancer research
2013
Nobis M, McGhee EJ, Morton JP, Schwarz JP 等 17 人
癌症侵袭与转移发生在复杂三维环境中,并受周围宿主组织与血管的反馈调控。本研究建立了一种新型活体成像方法,用于揭示抗侵袭Src抑制剂dasatinib处理后Src活性的时空调控。作者采用基于荧光寿命成像显微镜–荧光共振能量转移(FLIM-FRET)的Src生物传感器,在p53突变转基因胰腺癌小鼠模型中实时监测药物靶向效力。与传统固定终...
Thyroid : official journal of the American Thyroid Association
2013
Geras-Raaka E, Neumann S, Gershengorn MC
本文检验甲状腺刺激激素受体(TSHR)在撤除 TSH 后是否发生持续 cAMP 信号,以及该现象是否细胞类型特异。作者采用两种方法:方法 1 用化学发光免疫分析,在培养液中加入磷酸二酯酶抑制剂 IBMX,定量 30–60 min 内细胞内 cAMP 积累;方法 2 用 FRET 型细胞内 cAMP 生物传感器 YR-ICUE 连续记...
Lab on a chip
2013
Yu JQ, Liu XF, Chin LK, Liu AQ 等 5 人
为研究糖尿病高糖条件下内皮细胞功能障碍机制,作者开发了血流动力学微流控芯片系统。该系统将基于caspase-3的荧光共振能量转移(FRET)生物传感器细胞系与可模拟血管脉动血流的微流控芯片结合,可实时、少量细胞地检测内皮细胞凋亡。HUVEC-C3细胞系稳定表达FRET传感蛋白,用于探测caspase-3激活;凋亡发生时传感细胞由绿色...
Molecular biology of the cell
2013
Ponik SM, Trier SM, Wozniak MA, Eliceiri KW 等 5 人
乳腺上皮细胞在柔顺的三维胶原凝胶中达到张力稳态时发生导管形态发生,该过程需要下调Rho活性。本研究在T47D细胞中比较p190RhoGAP-A与p190RhoGAP-B,发现p190RhoGAP-B而非p190RhoGAP-A介导柔顺三维胶原凝胶中RhoA活性下调和导管形态发生。RhoA与p190RhoGAP-B在细胞-细胞接触位点...
PloS one
2013
Lu S, Wang Y, Huang H, Pan Y 等 9 人
基质金属蛋白酶(MMPs)可重塑肿瘤微环境并促进癌症转移。其中,膜型1基质金属蛋白酶(MT1-MMP,MMP-14)具有促肿瘤和促转移作用,其蛋白水解活性是侵袭性肿瘤的重要可靶向生物标志物。本研究系统开发并表征了多种基于荧光共振能量转移(FRET)的高灵敏、高特异生物传感器,用于在活细胞中可视化MT1-MMP活性。经优化,AHLR-...
Biochemical pharmacology
2013
Cameron RT, Coleman RG, Day JP, Yalla KC 等 8 人
PDE4 是十一种环核苷酸磷酸二酯酶家族之一,在介导重要环核苷酸第二信使环磷酸腺苷(cAMP)的水解降解中起关键作用。PDE4 抑制剂具有抗炎特性,但其临床应用受限于机制相关副作用,限制最大耐受剂量。为启动开发耐受性更好的 PDE4 抑制剂,我们筛查现有已批准药物的 PDE4 抑制活性。为此,我们采用高通量计算方法,识别出耐受性良好...
Development, growth & differentiation
2013
Aoki K, Kamioka Y, Matsuda M
荧光蛋白成像技术的进步揭示了发育生物学中的多种生物过程。特别是基于荧光共振能量转移(FRET)原理的遗传编码生物传感器,已被用于在活细胞中可视化胞内信号分子的空间与时间动态。然而,高灵敏度FRET生物传感器的开发及其在发育生物学中的应用仍具挑战,限制了其广泛使用。本综述首先概述FRET生物传感器成像的一般流程与实验技巧,随后介绍FR...
Methods in enzymology
2013
Vilela M, Halidi N, Besson S, Elliott H 等 7 人
全面理解细胞信号转导需要准确测量分子通路中的信息流。过去,信息流主要依据遗传或蛋白-蛋白相互作用推断,但这些方法通常对细胞群体平均,难以捕捉仅在特定亚细胞区域短暂激活的信号通路。单细胞信号状态数据正在出现,但多为特定时间点快照或整细胞平均。蛋白活性生物传感器可在活细胞中测量信号分子的时空激活,其数据包含复杂动态信息,可沿时间和空间解...
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2013
Hinde E, Digman MA, Hahn KM, Gratton E
本文提出一种基于波动分析的 FRET 生物传感器检测方法,用于在活细胞中同时测量蛋白质的分子流与信号活性。作者将荧光寿命成像显微镜(FLIM)的相量(phasor)分析与沿毫秒级线扫描获取的交叉对关联函数(cross-pCF)分析相结合,检测 Rho GTPase 活性(即 FRET 生物传感器信号)的空间定位,并解析该活性群体所采...