Analytical and bioanalytical chemistry
2013
Ermini ML, Mariani S, Scarano S, Campa D 等 6 人
本文报道了一种基于表面等离子共振成像(SPRi)检测单核苷酸多态性(SNP)的策略优化。作者首先设计三明治式检测方案,并利用计算工具选择寡核苷酸序列,以研究ABCB1基因rs1045642位点SNP检测的优化条件。随后,在SPRi生物传感器上使用合成DNA序列进行优化,评估单碱基错配识别的最佳条件,包括多态位点在探针中的位置、探针长...
Biosensors & bioelectronics
2013
Lv X, Chen L, Zhang H, Mo J 等 8 人
本文报道了一种新型简单多孔硅多基对称光子晶体核酸生物传感器,用于检测昆虫(Microdera puntipennis dzungarica)抗冻蛋白基因。该传感器通过电化学刻蚀高p型硅制备,结构遵循(n1n2n3)6(n3n2n1)6序列,其中n1、n2、n3代表不同折射率层。与多种多孔硅光子结构相比,多基层结构更易制备且稳定性更好...
Biosensors & bioelectronics
2013
Ermini ML, Mariani S, Scarano S, Minunni M
基于生物传感器方法直接检测基因组DNA样本中的特定序列极具挑战。本研究开发了一种优化策略,利用表面等离子共振成像(SPRi)技术直接检测人类基因组样本中的DNA序列。以人类ABCB1基因序列为模型靶标,采用计算辅助方法设计探针。首先使用互补合成靶标评估探针功能,随后将该体系应用于从淋巴细胞提取的人类基因组DNA中靶序列的直接检测。为...
Biosensors
2012
Lazerges M, Perrot H, Rabehagasoa N, Compère C
本文报道了两种基于石英晶体微天平(QCM)的寡核苷酸生物传感器,用于检测产生麻痹性贝类毒素(PSP)的有毒微藻微小亚历山大藻(Alexandrium minutum)的基因序列。传感器在镀金石英表面分别接枝 20 碱基硫醇标记或生物素标记 DNA 探针,并通过与互补 20 碱基靶标 DNA 的特异性杂交实现识别。实验在受控流体力学条...
Analytica chimica acta
2012
Chen W, Liu YH, Li HN, Liu AL 等 6 人
本文报道了一种基于识别界面构象变化的超灵敏电化学阻抗谱DNA生物传感器。传统EIS DNA传感器通常依赖杂交后双链DNA的负电荷和空间位阻阻碍[Fe(CN)6]3-/4-接近电极,使电荷转移电阻增加,但高密度识别界面信号变化有限。本文利用巯基修饰单链DNA探针在室温下与金表面形成躺卧构象,碱基与金相互作用,并用BSA封闭暴露金位点、...
Genetics and molecular research : GMR
2012
Ali ME, Hashim U, Kashif M, Mustafa S 等 6 人
本研究以猪(Sus scrofa)线粒体基因组为靶标,通过 AluI 限制性内切酶 in silico 酶切,筛选出 5 个长度 15–30 nt、种间多态性高且种内保守的猪特异性短 DNA 标记,并经 NCBI BLAST 和 ClustalW 比对验证其对 11 种常见肉类动物和鱼类具有特异性。随后将四甲基罗丹明(TMR)标记的...
Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands)
2012
Qi X, Gao H, Zhang Y, Wang X 等 6 人
本文制备了由Co3O4纳米棒(nano-Co3O4)、石墨烯(GR)和壳聚糖(CTS)组成的纳米复合材料,并将其修饰在碳离子液体电极(CILE)表面,构建了一种新型电化学DNA生物传感器。单链DNA探针(ssDNA)通过静电吸附固定在CTS–Co3O4–GR/CILE表面,可在选定条件下与目标ssDNA序列杂交。以亚甲基蓝(MB)为...
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology
2012
Singh S, Srivastava A, Oh HM, Ahn CY 等 6 人
蓝藻水华与气候变化和富营养化密切相关,是蓝藻毒素的重要来源,已成为全球关注的环境与公共卫生问题。微囊藻毒素具有强肝毒性、肾毒性和致癌性,威胁旅游、农业和动物健康,但微囊藻毒素产生调控机制仍不清楚;有毒与无毒蓝藻菌株共存以及多种微囊藻毒素变体的出现使检测更加复杂。虽然生物测定、ELISA、HPLC和LC-MS等分析方法已广泛应用,但生...
The Analyst
2012
Yan M, Zhang M, Ge S, Yu J 等 7 人
本文报道了一种基于纳米多孔金(NPG)电极和PdCu@碳纳米晶(CNCs)复合标签的高灵敏电化学发光(ECL)DNA生物传感器。CNCs通过石墨电氧化简便制备,表面富含羧基;NPG由银-金合金在硝酸中选择性溶银获得,具有可控三维孔道和自由支撑贵金属膜结构。以去合金化纳米多孔铜(NPC)为模板和还原剂,通过简单置换反应制备具有分级空心...
Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
2012
Zhang C, Xu J, Zhang S, Ji X 等 5 人
本文报道了一种一锅法合成 DNA–CdTe 量子点并用于序列特异性寡核苷酸检测的荧光生物传感器。传统 DNA 标记量子点多依赖链霉亲和素–生物素偶联或共价偶联,存在供体–受体距离大、成本高或合成步骤复杂等问题。作者以谷胱甘肽(GSH)和含硫代磷酸酯的特定序列 DNA 为共配体,一步合成不同发射波长的核酸功能化 CdTe 纳米晶,DN...
Journal of biotechnology
2012
Zhang D, Yan Y, Li Q, Yu T 等 8 人
本文报道了一种基于表面等离子共振(SPR)DNA生物传感器的无标记、高灵敏沙门氏菌检测方法。针对沙门氏菌invA基因设计生物素化单链寡核苷酸探针,并将其固定于链霉亲和素包被的羧甲基化葡聚糖传感表面。采用改良半巢式不对称PCR从细菌培养物中扩增invA基因,获得单链扩增产物用于杂交检测。合成靶DNA在5 nM至1000 nM范围内线性...
Bio Systems
2012
Sainz de Murieta I, Rodríguez-Patón A
尽管已有多种基于DNA链置换的分子器件设计,但尚无明确用于实现逻辑推演的系统。本文提出一种新的核酸生物传感器模型,利用DNA或RNA链编码简单诊断规则,例如“若DNA链1存在则疾病A”或“若DNA链1和DNA链2同时存在则疾病B”。该模型以链置换为基本操作,使编码规则与输入信号相互作用,并释放代表诊断结论的核苷酸链输出。输出信号既可...
Chemistry & biodiversity
2012
Werz E, Korneev S, Montilla-Martinez M, Wagner R 等 9 人
本文报道了一种面向新型DNA生物传感器技术的早期实验方法。作者将两种5′端带有双尾脂质修饰的寡核苷酸探针分别插入由POPE/POPC(8:2,w/w)组成的人工脂质双分子层中,该双分子层位于光学透明微流控样品载体的cis和trans通道之间。两个通道均充满生理缓冲液。向cis通道注入用Cy5标记的目标DNA序列后,若该序列仅与其中一...
Journal of nanobiotechnology
2012
Padmavathy B, Vinoth Kumar R, Jaffar Ali BM
临床与法医诊断需要高灵敏、快速且特异的DNA检测方法。PCR虽快速,但依赖熟练人员和昂贵设备。金纳米颗粒(AuNPs)因光学性质和易功能化,被用作超灵敏DNA检测信号探针。本文报道单链寡核苷酸功能化金纳米颗粒(AuNP-oligo probe)用于快速、特异性检测大肠杆菌。探针与含互补序列的目标DNA杂交后保持红色;无互补DNA时,...
Lab on a chip
2012
Peng HI, Strohsahl CM, Miller BL
本文报道了一种快速、定量、多重、自标记且可实时监测的 DNA 生物传感器。该装置将共价结合在银纳米颗粒(Ag NPs)表面的 DNA 发夹探针点阵化固定在微流控通道内,探针 3′ 端标记四甲基罗丹明(TMR)荧光基团。无目标 DNA 时,发夹探针折叠使 TMR 靠近银表面而被猝灭;互补目标 DNA 杂交后探针展开,TMR 进入金属增...
Biosensors & bioelectronics
2012
Subramanian S, Aschenbach KH, Evangelista JP, Najjar MB 等 6 人
本文报道了一种无需 PCR 扩增和分子标记即可检测细菌基因组 DNA 微量片段的电子传感平台。该系统采用碳纳米管场效应晶体管(CNT-FET)阵列,其电学特性可被活性区上极微弱的局部电荷所调制。研究以两种致病性大肠杆菌菌株评价器件检测性能,系统考察了合成寡核苷酸、未纯化和高纯度基因组 DNA 在不同浓度下的响应,并与非特异性结合进行...
Biosensors & bioelectronics
2012
Gu Y, Lai MT
本研究通过电化学合成聚(3,4-乙烯二氧噻吩)(PEDOT)和聚(对氨基苯甲酸)(poly(PABA))修饰铂线,构建了一种无标记 DNA 生物传感器。设计好的单链 DNA 寡核苷酸通过 poly(PABA) 的羧基固定于电极表面作为探针,在适当条件下与目标 DNA 杂交。采用差分脉冲伏安法(DPV)在柔红霉素盐酸盐存在下表征杂交效...
Journal of biomedical optics
2011
Zhang B, Dallo S, Peterson R, Hussain S 等 6 人
炭疽杆菌(Bacillus anthracis)因其质粒编码的毒力因子而具有生物武器威胁,其中 lef 基因编码致死因子。本文报道了一种基于光子晶体结构并采用全内反射(TIR)构型的快速、高灵敏炭疽 DNA 生物传感器。用于检测 lef 基因时,将单链 lef 探针 DNA 进行生物素化,并通过生物素—链霉亲和素相互作用固定于传感器...
Sensors (Basel, Switzerland)
2011
García-Martinez G, Bustabad EA, Perrot H, Gabrielli C 等 11 人
本文报道了一种基于 50 MHz 石英晶体微天平(QCM)电子振荡器电路的高灵敏度 DNA 序列检测生物传感器的设计与实验研究。该振荡器采用 Miller 拓扑结构,能够在液体阻尼介质中维持 Barkhausen 振荡条件,从而适用于液相环境下的质量传感。作者对振荡器进行了频率噪声与稳定性校准,利用 Allan 偏差确定其检测极限,...
Talanta
2011
Sun W, Qi X, Chen Y, Liu S 等 5 人
本文以碳离子液体电极(CILE)为基底,构建壳聚糖(CTS)/四氧化三铁微球(Fe3O4)–石墨烯(GR)纳米复合修饰的电化学DNA生物传感器。单链DNA探针直接固定于CTS/Fe3O4–GR/CILE表面,在优化条件下与目标单链DNA杂交。以亚甲基蓝(MB)为电化学指示剂,通过差分脉冲伏安法测量MB还原峰电流研究杂交反应。Fe3O...